70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1855 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  78.42 
 
 
295 aa  268  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  76.6 
 
 
233 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  63.69 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  60.32 
 
 
256 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  59.12 
 
 
234 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  58.01 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  48.44 
 
 
287 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  54.46 
 
 
219 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  51.98 
 
 
234 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  56.92 
 
 
203 aa  188  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  58.15 
 
 
214 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  57.8 
 
 
258 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  56.04 
 
 
206 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  52.38 
 
 
227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  64 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  57.92 
 
 
217 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  58.56 
 
 
220 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  56.67 
 
 
244 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  61.49 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  54.8 
 
 
213 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  61.83 
 
 
218 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  61.83 
 
 
218 aa  168  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  49.28 
 
 
238 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  45.25 
 
 
249 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  51.72 
 
 
213 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  52.88 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  55.56 
 
 
228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  39.78 
 
 
225 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  35.35 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  39.2 
 
 
211 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  37.57 
 
 
222 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  37.29 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  32.61 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  34.76 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  34.76 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  34.76 
 
 
214 aa  92  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  34.76 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  34.76 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  34.76 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  34.59 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  34.15 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  26.84 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  26.84 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  30.98 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  24.07 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  28.72 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  30.29 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  22.97 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  23.24 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  23.24 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  21.63 
 
 
221 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  24.32 
 
 
221 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  28.32 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  22.7 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5653  hypothetical protein  22.28 
 
 
208 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5255  hypothetical protein  22.28 
 
 
208 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5498  hypothetical protein  22.28 
 
 
208 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  22.7 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  22 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  22 
 
 
208 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  22.28 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5582  hypothetical protein  22.49 
 
 
208 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5532  hypothetical protein  22.49 
 
 
208 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5526  hypothetical protein  22.28 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5196  hypothetical protein  21.53 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  22.87 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0871  hypothetical protein  26.37 
 
 
208 aa  42  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>