37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1581 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  263  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  263  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  263  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  81.75 
 
 		 136 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  83.2 
 
 		 139 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  76.19 
 
 		 133 aa  197  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  73.77 
 
 		 139 aa  187  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  59.38 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  51.97 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  53.17 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  54.92 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  58.87 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  53.28 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  54.47 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  54.05 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  52.99 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 136 aa  120  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  47.97 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  45.16 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  50 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  45.67 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  46.67 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 139 aa  106  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 163 aa  98.6  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 242 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1857 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.25 
 
 		 703 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1917  response regulator receiver  31 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  28.89 
 
 		 1111 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  31.46 
 
 		 227 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 211 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>