More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1264 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  87.03 
 
 		 418 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  99.26 
 
 		 406 aa  783    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  787    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 406 aa  787    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  85.38 
 
 		 390 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  78.91 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  70.65 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  71.09 
 
 		 398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  57.75 
 
 		 406 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  57.65 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  57.47 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  57.03 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  58.51 
 
 		 399 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  49.36 
 
 		 401 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  49.43 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  46.52 
 
 		 405 aa  283  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  44.96 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1828  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 		 412 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2807  major facilitator superfamily MFS_1  48.35 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.297836  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  32 
 
 		 389 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  32.27 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  32 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  32 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  32 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  32 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  32 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  32 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  32 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 389 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 394 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  35.05 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  36.34 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  35.34 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  35.33 
 
 		 403 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  31.13 
 
 		 905 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  36.81 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  36.81 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  34.79 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 404 aa  167  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  33.15 
 
 		 403 aa  166  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  30.43 
 
 		 912 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  37.81 
 
 		 403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.78 
 
 		 895 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  35.71 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  36.99 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  35.79 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  30.7 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  34.07 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  36.71 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  30.98 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  30.46 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  30.46 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 409 aa  149  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  33.49 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  30.7 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  34.06 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 443 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  33.82 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  33.82 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  28.97 
 
 		 436 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  31.01 
 
 		 428 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  30.64 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  33.41 
 
 		 893 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  36.7 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 444 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  37.22 
 
 		 431 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  29.6 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 453 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  33.45 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  31.8 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.74 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.74 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>