More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1172 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  99.62 
 
 
263 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  75.29 
 
 
262 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  71.6 
 
 
236 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  67.48 
 
 
243 aa  319  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.49 
 
 
254 aa  309  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.6 
 
 
251 aa  295  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  59.67 
 
 
253 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.14 
 
 
244 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.73 
 
 
268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.5 
 
 
244 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.22 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.75 
 
 
252 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.57 
 
 
238 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  53.33 
 
 
1088 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.17 
 
 
249 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59.59 
 
 
243 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.99 
 
 
250 aa  238  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.71 
 
 
1051 aa  230  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.93 
 
 
262 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  49.15 
 
 
1053 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.28 
 
 
1053 aa  225  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.25 
 
 
240 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.54 
 
 
525 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.28 
 
 
1055 aa  221  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  49.57 
 
 
1314 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.32 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.98 
 
 
1052 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.19 
 
 
1051 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.42 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.19 
 
 
1050 aa  211  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.42 
 
 
246 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.42 
 
 
252 aa  208  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.95 
 
 
258 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.85 
 
 
248 aa  202  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.22 
 
 
260 aa  201  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.21 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.58 
 
 
252 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.51 
 
 
250 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.68 
 
 
1053 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.43 
 
 
1125 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  36.73 
 
 
1327 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.16 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  33.62 
 
 
219 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  35.54 
 
 
218 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.96 
 
 
214 aa  99.4  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  33.89 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  31.09 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.38 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.64 
 
 
242 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
456 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.12 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.31 
 
 
456 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.19 
 
 
233 aa  87  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.19 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.53 
 
 
456 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  32.1 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  33.19 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  32.14 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  31.2 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.8 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  32.64 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  32.19 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.44 
 
 
965 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.86 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  29.77 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.77 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  30.87 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  25.74 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.8 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  28.37 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  32.34 
 
 
986 aa  77  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  32.11 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.34 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  28.64 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.03 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  29.77 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  29.91 
 
 
585 aa  75.5  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  31.65 
 
 
978 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.52 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.79 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.6 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.99 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.78 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.33 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  30.94 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.33 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  27.23 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  24.69 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  29.33 
 
 
233 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  31.25 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  27.97 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.5 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  31.4 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>