More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1147 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
369 aa  740    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
369 aa  740    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
369 aa  740    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  83.78 
 
 
362 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  83.14 
 
 
362 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  46.11 
 
 
373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  41.26 
 
 
349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  43.52 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
400 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  42.82 
 
 
397 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 
423 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  41.06 
 
 
390 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
366 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  41.14 
 
 
364 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.49 
 
 
330 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
364 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
421 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 
350 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  38.69 
 
 
360 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  36.96 
 
 
344 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 
306 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 
389 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 
306 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 
348 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 
336 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
333 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 
347 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.88 
 
 
296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  34.08 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  34.08 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  34.08 
 
 
318 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 
352 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  32.99 
 
 
312 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
347 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
353 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  29.5 
 
 
299 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.59 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.43 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.66 
 
 
283 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  30.72 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  27.65 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
270 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.24 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
278 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.59 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  25.77 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.12 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.18 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  29.02 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.75 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.95 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.82 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 
270 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
263 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
264 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
273 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 
260 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
260 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
273 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 
271 aa  67  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>