More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1130 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  302  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  302  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 147 aa  302  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  91.16 
 
 		 147 aa  282  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  87.07 
 
 		 147 aa  273  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  79.59 
 
 		 147 aa  254  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  70.27 
 
 		 148 aa  222  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 149 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  69.39 
 
 		 147 aa  209  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  209  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 150 aa  207  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  206  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  206  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  206  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  204  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 147 aa  203  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  68.03 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 147 aa  200  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  63.95 
 
 		 147 aa  201  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 149 aa  196  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  65.1 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  61.9 
 
 		 147 aa  193  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  61.9 
 
 		 147 aa  193  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  62.59 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  60.42 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  60 
 
 		 146 aa  183  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 146 aa  179  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  55.86 
 
 		 145 aa  176  9e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 		 144 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  60.87 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  55.78 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  55.78 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  56.2 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 149 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  52.78 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 143 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2341  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 151 aa  169  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0253  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799965  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1115  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2519  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0330  ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000116087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  57.34 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 149 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 176 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>