61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1068 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  547  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  547  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  99.28 
 
 
276 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  88 
 
 
281 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  82.69 
 
 
294 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  76.28 
 
 
285 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  67.88 
 
 
283 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  67.88 
 
 
283 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  67.88 
 
 
283 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  67.52 
 
 
285 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  67.27 
 
 
287 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  59.22 
 
 
272 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  57.48 
 
 
280 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  57.5 
 
 
288 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  52.54 
 
 
279 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  54.92 
 
 
281 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  53.44 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  52.82 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  49.06 
 
 
291 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  48.69 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  52.54 
 
 
283 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  49.19 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  50.21 
 
 
286 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  48.55 
 
 
286 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  44.9 
 
 
297 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  43.28 
 
 
285 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  44.84 
 
 
301 aa  185  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  41.88 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  41.37 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  41.37 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  41.37 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  43.44 
 
 
304 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  43.08 
 
 
303 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  42.6 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  43.04 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  42.41 
 
 
307 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  37.91 
 
 
324 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  40.36 
 
 
324 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  40.65 
 
 
301 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  37.88 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.11 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.04 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  25.5 
 
 
318 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  27.31 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  27.57 
 
 
306 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  25.77 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  26.07 
 
 
346 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
344 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  26.26 
 
 
335 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  28.64 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  23.7 
 
 
350 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  26.37 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  23.7 
 
 
350 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  38.27 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2486  luciferase family oxidoreductase, group 1  32.23 
 
 
326 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.536185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.08 
 
 
351 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  25.93 
 
 
353 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1091  Luciferase-like monooxygenase  32.94 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 
283 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>