61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1067 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  77.58 
 
 
285 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  77.5 
 
 
287 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  65.96 
 
 
294 aa  374  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  67.03 
 
 
281 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  67.88 
 
 
276 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  67.88 
 
 
276 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  67.52 
 
 
276 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  64.62 
 
 
285 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.04 
 
 
280 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  54.78 
 
 
272 aa  285  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  54.91 
 
 
279 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  56.08 
 
 
281 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  52.73 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  52.83 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  47.7 
 
 
288 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  49.23 
 
 
290 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  50.37 
 
 
283 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  45.49 
 
 
285 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  43.96 
 
 
286 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  43.92 
 
 
297 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  45.83 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  45 
 
 
286 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  40.07 
 
 
304 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  41.5 
 
 
296 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  38.1 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  42.47 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  43.61 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  36.05 
 
 
303 aa  175  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  39.78 
 
 
324 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  37.99 
 
 
307 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  37.73 
 
 
324 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  38.7 
 
 
275 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  33.45 
 
 
303 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  33.45 
 
 
303 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  33.45 
 
 
303 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  36.86 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  33.59 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.55 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  26.24 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.06 
 
 
327 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  26.46 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  24.82 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  26.52 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  25.37 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  24.34 
 
 
359 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  25.16 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  26.01 
 
 
341 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  22 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  22 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  24.43 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  22.03 
 
 
360 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.31 
 
 
332 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  25.25 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  23.67 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.33 
 
 
361 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  20.32 
 
 
336 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>