More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1061 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  100 
 
 		 338 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 338 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  97.04 
 
 		 338 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  62.06 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  62.61 
 
 		 348 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  57.01 
 
 		 340 aa  332  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  56.68 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  51.08 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  53.82 
 
 		 343 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  45.58 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  40.79 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  42.34 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  41.34 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  41.57 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  39.52 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 445 aa  75.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  29.27 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  28.12 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.64 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.66 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  24.45 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  21.36 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 457 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.95 
 
 		 435 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.2 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.95 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  29.93 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  28.67 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.34 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.62 
 
 		 449 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  31.69 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  27.03 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3048  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  28.8 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  31.33 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.28 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.16 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  33.53 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  30.27 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3239  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  27.81 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  28.53 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.42 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  22.15 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  25.81 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  31.98 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  27.71 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  23.75 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.37 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  22.14 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  25.41 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.39 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2389  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  29.39 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2019  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  29.39 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0957  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.19 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  21.84 
 
 		 402 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  29.5 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>