More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1034 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
149 aa  297  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
149 aa  297  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
149 aa  297  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  83.78 
 
 
148 aa  252  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  84.93 
 
 
147 aa  250  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  82.64 
 
 
146 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  82.64 
 
 
146 aa  238  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  76.55 
 
 
152 aa  226  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  73.43 
 
 
164 aa  217  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  73.24 
 
 
152 aa  211  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  73.1 
 
 
147 aa  207  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  70.34 
 
 
147 aa  204  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  70.42 
 
 
152 aa  203  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  68.97 
 
 
147 aa  199  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  68.31 
 
 
146 aa  199  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  66.21 
 
 
158 aa  197  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  67.83 
 
 
243 aa  196  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  65.28 
 
 
146 aa  196  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  65.73 
 
 
210 aa  196  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  65.73 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  70.83 
 
 
148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  66.43 
 
 
176 aa  194  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  65.52 
 
 
153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  69.93 
 
 
147 aa  192  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  66.21 
 
 
151 aa  190  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  63.89 
 
 
163 aa  190  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  67.14 
 
 
164 aa  189  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  65.75 
 
 
150 aa  189  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  63.09 
 
 
149 aa  188  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  63.7 
 
 
151 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  65.99 
 
 
154 aa  187  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  65 
 
 
177 aa  185  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  58.94 
 
 
151 aa  180  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  66.67 
 
 
164 aa  180  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  65.28 
 
 
161 aa  174  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  57.53 
 
 
150 aa  170  5.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  56.85 
 
 
151 aa  165  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  60.69 
 
 
147 aa  150  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  53.1 
 
 
150 aa  130  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  52.6 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  44.9 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  50 
 
 
153 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  54.61 
 
 
166 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  44.22 
 
 
153 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  48.25 
 
 
147 aa  122  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 
161 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  51.05 
 
 
146 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  48.99 
 
 
170 aa  121  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  43.24 
 
 
153 aa  120  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  43.24 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  51.39 
 
 
149 aa  118  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  51.05 
 
 
172 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  45.95 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 
146 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  48.39 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  43.15 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  42.66 
 
 
148 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 
147 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 
146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  47.71 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  46 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  42.28 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 
146 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  48.28 
 
 
147 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  45.64 
 
 
153 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  46.85 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  46.9 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  47.65 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  45.27 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  46.62 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  49.32 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  43.62 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  49.3 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  50.69 
 
 
148 aa  107  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 
144 aa  107  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 
146 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  46.85 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  49.65 
 
 
146 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  46.85 
 
 
146 aa  105  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  46.31 
 
 
149 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 
144 aa  106  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  46.1 
 
 
144 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>