198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1033 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1033  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000415927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1050  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0317363  normal  0.122599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1062  50S ribosomal protein L30  98.31 
 
 		 59 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000861748  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  93.22 
 
 		 59 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  93.22 
 
 		 61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  74.58 
 
 		 65 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  72.88 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 59 aa  84.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  69.49 
 
 		 60 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  69.49 
 
 		 60 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  64.41 
 
 		 60 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 61 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  61.02 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  54.24 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  52.54 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  49.15 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  49.15 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  52.46 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  52.54 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  49.12 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000049489  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1104  ribosomal protein L30p/L7e  57.63 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  50 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  47.54 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  43.1 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  50.1  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  39.34 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0772  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000348111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  39.34 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 61 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0774  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.797874  normal  0.0109513 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0283  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147317  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  37.5 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>