More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0770 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  99.5 
 
 
406 aa  780    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
400 aa  783    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  99.75 
 
 
406 aa  781    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  80.42 
 
 
418 aa  607  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  79.31 
 
 
416 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  77.84 
 
 
408 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  61.72 
 
 
417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  60.26 
 
 
415 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  58.1 
 
 
435 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  39.39 
 
 
436 aa  256  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  37.91 
 
 
418 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  38.2 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  35.24 
 
 
434 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  36.48 
 
 
424 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  35.84 
 
 
435 aa  209  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  35.19 
 
 
423 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  36.43 
 
 
443 aa  209  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  37.23 
 
 
431 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  35.75 
 
 
431 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  35.38 
 
 
423 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  34.47 
 
 
426 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  37.01 
 
 
419 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  35.84 
 
 
434 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  35.11 
 
 
443 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  35.38 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  35.61 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  34.83 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  36.59 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  33.91 
 
 
430 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  35.13 
 
 
431 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  33.76 
 
 
440 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  31.85 
 
 
457 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  32.84 
 
 
424 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  33.1 
 
 
466 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  34.71 
 
 
393 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  32.56 
 
 
393 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  40 
 
 
409 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  33.76 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  33.76 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  33.76 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.31 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  30.4 
 
 
384 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  35.31 
 
 
420 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  31.89 
 
 
398 aa  123  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  28.04 
 
 
415 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  34.23 
 
 
425 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  32.41 
 
 
398 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  33.93 
 
 
411 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.9 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  34.09 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.74 
 
 
375 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  35.64 
 
 
429 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.53 
 
 
362 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  31.12 
 
 
384 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  33.02 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
403 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.98 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  31.08 
 
 
384 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.86 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  31.01 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  30.19 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  36.39 
 
 
373 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 
368 aa  86.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 
406 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 
370 aa  86.3  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  29.69 
 
 
383 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  31.05 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 
402 aa  84  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  24.81 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  30.13 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  31.38 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  31.59 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  31.59 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  22.97 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  30.28 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.79 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.92 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  23.41 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.34 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>