230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0746 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  99.48 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  83.16 
 
 		 195 aa  309  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  84.24 
 
 		 195 aa  303  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  34.86 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  25.27 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  55.1 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 224 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.56 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  32.32 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  46.81 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 400 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  24.68 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  27.13 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 190 aa  44.7  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  33.33 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 276 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  32.65 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>