124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0621 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  988    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  96.65 
 
 
508 aa  880    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  95.6 
 
 
508 aa  895    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  988    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  96.65 
 
 
508 aa  880    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  95.6 
 
 
508 aa  895    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  68.52 
 
 
582 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  63.88 
 
 
586 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  66.48 
 
 
571 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  99.39 
 
 
491 aa  982    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  95.03 
 
 
514 aa  895    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  99.16 
 
 
516 aa  877    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  71.12 
 
 
532 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  64.13 
 
 
506 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  49.6 
 
 
550 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  66.77 
 
 
601 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  66.32 
 
 
601 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  49.27 
 
 
519 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  63.97 
 
 
593 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  42.13 
 
 
546 aa  323  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  40.58 
 
 
535 aa  316  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  41.92 
 
 
517 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  41.62 
 
 
519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  41.33 
 
 
524 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  40.75 
 
 
511 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  42.43 
 
 
488 aa  293  6e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  37.96 
 
 
539 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  37.7 
 
 
512 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  38.19 
 
 
480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  38.19 
 
 
480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  37.99 
 
 
480 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  36.5 
 
 
550 aa  270  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  37.82 
 
 
473 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  36.59 
 
 
464 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  40.75 
 
 
441 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  41.11 
 
 
516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  52.07 
 
 
578 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  51.36 
 
 
581 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  51.36 
 
 
581 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  51.9 
 
 
578 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  48.78 
 
 
593 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  57.99 
 
 
578 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  48.78 
 
 
593 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  57.99 
 
 
578 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  34.35 
 
 
567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  37.24 
 
 
484 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  48.98 
 
 
620 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  27.66 
 
 
519 aa  127  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  27.17 
 
 
579 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  27.71 
 
 
566 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  47.41 
 
 
637 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  50 
 
 
635 aa  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  49.44 
 
 
748 aa  90.1  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  54.88 
 
 
620 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  33.02 
 
 
475 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  49.4 
 
 
709 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  47.31 
 
 
743 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  48.39 
 
 
565 aa  80.5  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  29.96 
 
 
618 aa  80.1  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  50 
 
 
198 aa  79.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  42.71 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  42.06 
 
 
498 aa  76.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  41.13 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  38.16 
 
 
169 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  42.57 
 
 
628 aa  70.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  40.34 
 
 
602 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  43.48 
 
 
714 aa  66.6  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  40.45 
 
 
427 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  40.45 
 
 
434 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  28.8 
 
 
586 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  29.46 
 
 
554 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  44.79 
 
 
122 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  41.58 
 
 
516 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  39.13 
 
 
567 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  26.68 
 
 
535 aa  63.9  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  40 
 
 
605 aa  63.5  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  42.39 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  36.96 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  35.04 
 
 
510 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  36.43 
 
 
580 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  32.64 
 
 
499 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  48.57 
 
 
551 aa  60.1  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  41.3 
 
 
443 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  49.23 
 
 
580 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  47.69 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  44.12 
 
 
117 aa  59.3  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  42.68 
 
 
584 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  38.2 
 
 
566 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  36.78 
 
 
568 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  36.78 
 
 
620 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  33.86 
 
 
553 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  34.35 
 
 
556 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  35.63 
 
 
585 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  38.38 
 
 
512 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  41.33 
 
 
603 aa  50.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  46 
 
 
131 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3701  hypothetical protein  49.48 
 
 
129 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  37.93 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  26.15 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  47.06 
 
 
496 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>