More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0515 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0504  adenylosuccinate synthetase  99.77 
 
 
431 aa  865    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4054  adenylosuccinate synthetase  82.94 
 
 
428 aa  714    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.441295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38190  adenylosuccinate synthetase  78.5 
 
 
428 aa  651    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5137  adenylosuccinate synthetase  78.04 
 
 
433 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0515  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
431 aa  867    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6908  adenylosuccinate synthetase  78.32 
 
 
429 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0228  adenylosuccinate synthetase  98.38 
 
 
431 aa  858    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.043517  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10362  adenylosuccinate synthetase  88.55 
 
 
432 aa  774    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698825  normal  0.94506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  81.07 
 
 
428 aa  717    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0526  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
431 aa  867    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  96.04 
 
 
431 aa  839    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4777  adenylosuccinate synthetase  73.6 
 
 
429 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  68.25 
 
 
427 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  69.01 
 
 
427 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  65.42 
 
 
427 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 
427 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  68.22 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  68.16 
 
 
428 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  66.59 
 
 
427 aa  578  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  67.76 
 
 
427 aa  579  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  66.82 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  64.95 
 
 
807 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  64.95 
 
 
429 aa  569  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  63.08 
 
 
429 aa  565  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  63.32 
 
 
429 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 
430 aa  565  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  62.62 
 
 
429 aa  565  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  64.34 
 
 
429 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  63.55 
 
 
432 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  62.96 
 
 
432 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  62.88 
 
 
428 aa  547  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  61.88 
 
 
428 aa  544  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  60.05 
 
 
428 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  59.95 
 
 
428 aa  530  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4119  adenylosuccinate synthetase  60.28 
 
 
428 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0180773  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02210  adenylosuccinate synthetase  61.92 
 
 
429 aa  525  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  60.42 
 
 
433 aa  522  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05720  adenylosuccinate synthetase  59.33 
 
 
445 aa  520  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  57.61 
 
 
434 aa  486  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  56.54 
 
 
427 aa  485  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  54.71 
 
 
438 aa  480  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  53.5 
 
 
427 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  54.46 
 
 
447 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  53.05 
 
 
426 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  51.28 
 
 
430 aa  461  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
430 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  54.46 
 
 
447 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  53.99 
 
 
447 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
428 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  52.9 
 
 
430 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  55.97 
 
 
427 aa  455  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  53.52 
 
 
444 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  51.75 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  50.58 
 
 
428 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  52.35 
 
 
449 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  52.82 
 
 
437 aa  450  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  54.25 
 
 
426 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  53.18 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1841  Adenylosuccinate synthase  52.2 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.842522  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  51.64 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  53.3 
 
 
426 aa  448  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
429 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0035  adenylosuccinate synthetase  55.63 
 
 
438 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
429 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
429 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  53.04 
 
 
432 aa  443  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  51.99 
 
 
429 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  52.11 
 
 
444 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
424 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  52.34 
 
 
430 aa  441  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  53.99 
 
 
427 aa  441  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
427 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0444  adenylosuccinate synthase  52.24 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  54.61 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  51.77 
 
 
429 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 
432 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4214  adenylosuccinate synthase  52.47 
 
 
430 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.855707  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0360  adenylosuccinate synthetase  50.82 
 
 
432 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655854  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 
427 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  53.43 
 
 
425 aa  437  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  51.06 
 
 
432 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  53.27 
 
 
431 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2504  adenylosuccinate synthetase  53.65 
 
 
431 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000458788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>