39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0434 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  98.8 
 
 
249 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0601  hypothetical protein  65.06 
 
 
248 aa  320  9.000000000000001e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.492856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0287  hypothetical protein  68 
 
 
248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000041503  normal  0.144658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10337  hypothetical protein  56.57 
 
 
261 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5043  hypothetical protein  52.21 
 
 
246 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1392  protein of unknown function DUF1503  37.75 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9026  hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5259  hypothetical protein  35.47 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6764  protein of unknown function DUF1503  34.76 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0650  protein of unknown function DUF1503  29.91 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2998  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6055  protein of unknown function DUF1503  30.83 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.585971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2951  protein of unknown function DUF1503  30.84 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0394  hypothetical protein  30.99 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2346  hypothetical protein  29.11 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2217  protein of unknown function DUF1503  33.54 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0327  hypothetical protein  30.04 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5133  protein of unknown function DUF1503  31.88 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4265  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2667  protein of unknown function DUF1503  28.14 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0119  hypothetical protein  37.78 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2467  hypothetical protein  28.24 
 
 
266 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3207  protein of unknown function DUF1503  27.23 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0703058  normal  0.0564696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6860  protein of unknown function DUF1503  27.7 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9205  hypothetical protein  34.23 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2202  protein of unknown function DUF1503  28.99 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4616  protein of unknown function DUF1503  29.52 
 
 
283 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2255  protein of unknown function DUF1503  30.53 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0474  protein of unknown function DUF1503  27.12 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1989  protein of unknown function DUF1503  27.27 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19770  hypothetical protein  25.5 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4528  hypothetical protein  26.83 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5850  hypothetical protein  27.34 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1875  protein of unknown function DUF1503  27.88 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142051  normal  0.0199341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  29.17 
 
 
182 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  28.93 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  34.13 
 
 
198 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>