59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0425 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  35.91 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  35.67 
 
 
408 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  33.42 
 
 
420 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  38.01 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  38.49 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.79 
 
 
411 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  34.11 
 
 
467 aa  142  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.12 
 
 
444 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  34.6 
 
 
421 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  38.28 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  33.33 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  34.16 
 
 
408 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  36.48 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  34.17 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  33.03 
 
 
427 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  32.33 
 
 
425 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  30.89 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  31.01 
 
 
494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  30.89 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  32.35 
 
 
477 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  33.96 
 
 
431 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  30.62 
 
 
418 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  28.68 
 
 
428 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  35.69 
 
 
463 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  33.9 
 
 
412 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  34.74 
 
 
470 aa  106  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  34.32 
 
 
422 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  34.32 
 
 
422 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  34.32 
 
 
422 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  30.99 
 
 
478 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  39.62 
 
 
395 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  30.03 
 
 
430 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  33.66 
 
 
477 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  31.22 
 
 
420 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  31.87 
 
 
417 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  37.72 
 
 
378 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  34.43 
 
 
369 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  28.74 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.44 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.44 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.44 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  29.17 
 
 
455 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  34 
 
 
438 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  34 
 
 
438 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  34 
 
 
438 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  30.97 
 
 
417 aa  93.2  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  31.19 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  30.72 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  32.59 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  28.13 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  28.13 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  28.13 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.41 
 
 
570 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  35.64 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  32.17 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  31.75 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>