43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0397 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  97.7 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  76.8 
 
 		 230 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  67.57 
 
 		 218 aa  301  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  65.75 
 
 		 221 aa  295  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  40.23 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.35 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.05 
 
 		 314 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  30.06 
 
 		 530 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  35.52 
 
 		 503 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  31.65 
 
 		 275 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  37.63 
 
 		 295 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  32.61 
 
 		 503 aa  88.6  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  32.73 
 
 		 358 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  28.16 
 
 		 454 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  26.94 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  30.47 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  34.13 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  34.29 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  26.04 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1222  S-layer domain protein  34.34 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  27.92 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  31.94 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0935  hypothetical protein  25.99 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0237848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  32.9 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  27.1 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  27.17 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5607  hypothetical protein  25.13 
 
 		 313 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133925  decreased coverage  0.000118142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  31.47 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3179  hypothetical protein  25.74 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  26.92 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.28 
 
 		 173 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  24.31 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  27.39 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  27.52 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  27.46 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  27.52 
 
 		 164 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  26.39 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  29.87 
 
 		 695 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  27.46 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.2 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>