90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0263 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  100 
 
 
382 aa  740  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  99.74 
 
 
382 aa  737  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  100 
 
 
382 aa  740  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  87.6 
 
 
380 aa  627  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  87.11 
 
 
380 aa  624  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  72.27 
 
 
381 aa  538  1e-152  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  58.93 
 
 
378 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  57.34 
 
 
377 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.47 
 
 
391 aa  352  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  5.62153e-06 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.13 
 
 
362 aa  328  1e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.82 
 
 
390 aa  326  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.87789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.41 
 
 
362 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  52.85 
 
 
383 aa  322  9e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.37 
 
 
381 aa  320  2e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  1.57223e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.12 
 
 
383 aa  318  8e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  52.57 
 
 
376 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  49.6 
 
 
389 aa  315  1e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.34 
 
 
368 aa  313  4e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  48.79 
 
 
391 aa  285  1e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  44.54 
 
 
377 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  46.52 
 
 
372 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  44.54 
 
 
394 aa  253  4e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  46.72 
 
 
387 aa  253  5e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  45.95 
 
 
381 aa  249  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  45.95 
 
 
369 aa  239  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.7 
 
 
387 aa  233  4e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.76 
 
 
387 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92794e-08 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  42.47 
 
 
419 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.32035e-05  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.71 
 
 
372 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  40.69 
 
 
435 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.29 
 
 
281 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  30.04 
 
 
266 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  6.0174e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  30.65 
 
 
264 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.48 
 
 
284 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.6 
 
 
271 aa  85.9  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.78 
 
 
261 aa  84  4e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  31.66 
 
 
277 aa  83.6  5e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.69 
 
 
291 aa  82.8  9e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.44 
 
 
269 aa  80.5  4e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.52 
 
 
511 aa  79  1e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.67 
 
 
269 aa  69.7  8e-11  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.95 
 
 
284 aa  69.7  8e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.13 
 
 
281 aa  67.8  3e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.27 
 
 
503 aa  65.1  2e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.51 
 
 
280 aa  64.3  4e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  31.35 
 
 
513 aa  63.5  6e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.82 
 
 
503 aa  63.5  6e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.35 
 
 
281 aa  61.6  2e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  28.57 
 
 
276 aa  61.2  3e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.90734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.79 
 
 
503 aa  60.8  4e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.6 
 
 
519 aa  56.2  9e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.52 
 
 
502 aa  55.5  2e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.5 
 
 
507 aa  54.7  3e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.45 
 
 
281 aa  51.2  3e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.37 
 
 
260 aa  50.8  4e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.17 
 
 
509 aa  50.4  5e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.72 
 
 
231 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.16 
 
 
491 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  26.51 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.54 
 
 
546 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 
275 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.84 
 
 
513 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.8 
 
 
513 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  30.11 
 
 
515 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  32.56 
 
 
227 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2724  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  29.93 
 
 
232 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00387379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3012  response regulator receiver protein  29.25 
 
 
232 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.721979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  30.33 
 
 
520 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 
226 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.42937e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  27.78 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  21.39 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  4.30064e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.3 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  21.39 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  31.07 
 
 
251 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 
225 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 
237 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2069  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.91 
 
 
522 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.198087  hitchhiker  0.000347629 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.97 
 
 
228 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  25.71 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  32.93 
 
 
1075 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  36.94 
 
 
217 aa  43.5  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  32.93 
 
 
1089 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  32.93 
 
 
1089 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0038  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 
223 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  28.95 
 
 
223 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  31.82 
 
 
1092 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.61 
 
 
277 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  35.09 
 
 
217 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>