More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0256 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  81.6 
 
 
253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  82.07 
 
 
252 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  74.6 
 
 
255 aa  361  6e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  67.34 
 
 
249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  38.96 
 
 
258 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  38.79 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  39.91 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  42.8 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  38.24 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  40.74 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.47 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  39.82 
 
 
253 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  40.51 
 
 
278 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  36.68 
 
 
253 aa  123  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.45 
 
 
274 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  40.81 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  35.98 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  37.97 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  27.89 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.76 
 
 
289 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  28.64 
 
 
274 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  40.73 
 
 
276 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  38.89 
 
 
255 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  29.09 
 
 
274 aa  111  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  40.93 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  39.33 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  35.43 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  35.54 
 
 
268 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  41.56 
 
 
253 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  32.2 
 
 
258 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.24 
 
 
260 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  41.56 
 
 
253 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  35.12 
 
 
274 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  35.93 
 
 
258 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  41.03 
 
 
292 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  33.76 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  35.5 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  35.5 
 
 
425 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  34.73 
 
 
282 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  36.8 
 
 
278 aa  95.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.17 
 
 
276 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  33.73 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  38.96 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  36.73 
 
 
253 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  35.68 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  33.75 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  34.32 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  34.43 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  30.97 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.75 
 
 
276 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  33.05 
 
 
282 aa  92  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  33.88 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  32.75 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  36.18 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  37.45 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  34.53 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  37.99 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  31.03 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  31.72 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  35.44 
 
 
274 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  32.64 
 
 
288 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  33.46 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  36.08 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  31.75 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.06 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  36.48 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  33.48 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  34.48 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  33.47 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.53 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  34.48 
 
 
306 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  34.48 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  34.18 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  34.48 
 
 
286 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  35.74 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  34.88 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  35.04 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  34.44 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  36.05 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  36.43 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  34.06 
 
 
279 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  37.07 
 
 
286 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  31.25 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  33.05 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  33.62 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  32.64 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.05 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  34.8 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  37.61 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  34.07 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  33.66 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2080  2-methylisocitrate lyase  34.8 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.734153  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  29.53 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  32.8 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  37.57 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>