More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0244 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  37.65 
 
 
7210 aa  899    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.59 
 
 
1402 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
3874 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 
2462 aa  811    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  35.57 
 
 
2719 aa  965    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.3 
 
 
2066 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.59 
 
 
2762 aa  972    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  37.89 
 
 
1955 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  38.71 
 
 
3670 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  34.38 
 
 
2111 aa  896    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  40.32 
 
 
2847 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  39.53 
 
 
1831 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.12 
 
 
1349 aa  793    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
2551 aa  879    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
1874 aa  936    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  44.98 
 
 
1656 aa  834    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  41.52 
 
 
1144 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  45.53 
 
 
1587 aa  815    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  43.95 
 
 
1337 aa  765    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  34.13 
 
 
3089 aa  1048    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  37.82 
 
 
3493 aa  1390    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  36.61 
 
 
4151 aa  1232    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
1816 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  42.89 
 
 
2047 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  40.39 
 
 
3252 aa  736    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.13 
 
 
2333 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  38.13 
 
 
5255 aa  803    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  32.94 
 
 
3508 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  38.28 
 
 
1584 aa  753    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 
3463 aa  867    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  36.96 
 
 
2081 aa  815    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.83 
 
 
3111 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  40.38 
 
 
4165 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  41.13 
 
 
3148 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 
5400 aa  870    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  36.79 
 
 
2090 aa  653    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  34.78 
 
 
3130 aa  1224    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
3693 aa  7413    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  33.26 
 
 
2101 aa  816    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  34.65 
 
 
1520 aa  720    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  40.53 
 
 
7279 aa  1389    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.13 
 
 
7110 aa  876    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  33.5 
 
 
2085 aa  886    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.35 
 
 
2024 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  34.82 
 
 
1537 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.37 
 
 
2551 aa  803    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  32.25 
 
 
1909 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  43.15 
 
 
1354 aa  801    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 
5154 aa  791    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  41.52 
 
 
2966 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  42.09 
 
 
3033 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  34.43 
 
 
2126 aa  884    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  41.5 
 
 
3099 aa  658    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  36.92 
 
 
2604 aa  1085    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 
1789 aa  680    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.34 
 
 
4478 aa  1103    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  35.9 
 
 
2126 aa  992    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.66 
 
 
3645 aa  901    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  34.42 
 
 
4111 aa  750    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
3693 aa  7413    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  41.97 
 
 
1602 aa  744    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  34.65 
 
 
1520 aa  720    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  43.32 
 
 
2374 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 
3092 aa  1525    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
2085 aa  886    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  40.31 
 
 
3254 aa  854    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  84.42 
 
 
3676 aa  6150    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  68.68 
 
 
2477 aa  1219    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  68.9 
 
 
3696 aa  4855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.55 
 
 
1832 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  37.15 
 
 
1805 aa  658    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  37.84 
 
 
1601 aa  799    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  44 
 
 
2107 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  38.83 
 
 
3408 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  33.89 
 
 
1827 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  31.91 
 
 
3080 aa  866    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  39.83 
 
 
3176 aa  1251    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  35.18 
 
 
3711 aa  841    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  43.77 
 
 
2376 aa  700    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  42.8 
 
 
2880 aa  899    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.88 
 
 
1939 aa  799    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  38.7 
 
 
3158 aa  1497    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  35.12 
 
 
2188 aa  967    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.27 
 
 
1087 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  99.4 
 
 
3702 aa  7317    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  33.61 
 
 
2108 aa  851    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  42.92 
 
 
2367 aa  728    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  34.72 
 
 
2230 aa  1059    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  33.61 
 
 
2085 aa  886    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  34.05 
 
 
4930 aa  756    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  36.68 
 
 
3494 aa  774    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  38.19 
 
 
1548 aa  789    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  44.48 
 
 
1559 aa  811    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  81.37 
 
 
3679 aa  5851    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  40.94 
 
 
4840 aa  828    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  39.76 
 
 
4607 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  34.08 
 
 
6768 aa  971    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  37.9 
 
 
1593 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  38.83 
 
 
4575 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.51 
 
 
2232 aa  1134    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>