More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0232 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  84 
 
 		 507 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 511 aa  1003    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 502 aa  984    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  99.8 
 
 		 502 aa  981    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  47.76 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  35.8 
 
 		 495 aa  260  3e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  35.61 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 475 aa  130  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 501 aa  127  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  27.04 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 		 497 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 492 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  25.05 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  29.58 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 517 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  24.58 
 
 		 456 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  25.95 
 
 		 467 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.67 
 
 		 449 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 454 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 485 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 495 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 491 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 484 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  26.67 
 
 		 449 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 443 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 450 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  26.65 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  25.22 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  25.22 
 
 		 450 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 527 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  24.52 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  24.52 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  25 
 
 		 461 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1963  amino acid transporter  26.18 
 
 		 447 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.041678  hitchhiker  0.00000000765672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 461 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  24.31 
 
 		 461 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  24.31 
 
 		 461 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  24.31 
 
 		 461 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 443 aa  91.3  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 443 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  26.65 
 
 		 447 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  25.16 
 
 		 461 aa  90.5  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 456 aa  90.1  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  26.24 
 
 		 447 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 443 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  24.95 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 516 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 485 aa  88.6  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 453 aa  88.2  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  26.78 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  27.85 
 
 		 447 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  26.09 
 
 		 497 aa  86.7  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  25.36 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  29.35 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  23.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  25.39 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  23.58 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  23.58 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  23.58 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  24.74 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  23.58 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>