More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0198 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0187  aminotransferase  99.29 
 
 		 425 aa  862    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1243  aminotransferase class-III  86.08 
 
 		 426 aa  760    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000210523  hitchhiker  0.000012077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0198  aminotransferase  100 
 
 		 425 aa  871    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0207  aminotransferase  100 
 
 		 425 aa  871    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5565  aminotransferase class-III  86.9 
 
 		 426 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0659  aminotransferase class-III  59.67 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2247  putative aminotransferase  49.14 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  34.6 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  30.43 
 
 		 460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  32.23 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.64 
 
 		 429 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.64 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.64 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.64 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.32 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  33.88 
 
 		 459 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  33.88 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  33.88 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.88 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.79 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.52 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.69 
 
 		 477 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.52 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.52 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.52 
 
 		 459 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.06 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  33.67 
 
 		 475 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.12 
 
 		 459 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  31.48 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.09 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  30.8 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  31.35 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  31.31 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3034  aminotransferase  32.65 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  34.25 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0117  aminotransferase class-III  30.83 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0673472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0230  aminotransferase  35.13 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.603227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.98 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  32.99 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  30.41 
 
 		 463 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  31.86 
 
 		 955 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0809  acetylornithine aminotransferase, putative  28.5 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2613  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.14 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2885  aminotransferase class-III  30.36 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0947361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  29.44 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  32.18 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3279  aminotransferase  31.07 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  32.46 
 
 		 440 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3215  aminotransferase class-III  32.08 
 
 		 477 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  32.14 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  32.4 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.33 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  30.87 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  29.49 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7208  aminotransferase class-III  34.87 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  32.3 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0775  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  29.47 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.02 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.75 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.75 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1071  aminotransferase class-III  29.29 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0325  aminotransferase class-III  33.72 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  29.35 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  32.93 
 
 		 994 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  28.61 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  30.05 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.29 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  29.74 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  29.74 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  29.32 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  30.71 
 
 		 436 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0163  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.83 
 
 		 401 aa  153  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0947  aminotransferase class-III  33.75 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0679656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2551  aminotransferase class-III  28.71 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  30.5 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4253  aminotransferase class-III  32.13 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4033  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.63 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.327701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0617  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.93 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  30.53 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3880  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.19 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2975  aminotransferase  32.48 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  30.1 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1633  aminotransferase  31.06 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.300646  hitchhiker  0.00646915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3854  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.68 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3754  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.19 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3697  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.19 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  32.24 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1728  aminotransferase class-III  31.18 
 
 		 463 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00289082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  31.79 
 
 		 397 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  27.12 
 
 		 891 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0571  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.19 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  29.16 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1499  aminotransferase class-III  33.43 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  28.12 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  28.47 
 
 		 443 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  34.48 
 
 		 845 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2676  aminotransferase class-III  33.05 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>