271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0112 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  72.99 
 
 
151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 
153 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  51.77 
 
 
153 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  51.77 
 
 
153 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  51.45 
 
 
147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  50.72 
 
 
147 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  51.91 
 
 
153 aa  144  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  47.89 
 
 
144 aa  145  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  48.95 
 
 
175 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  50.35 
 
 
143 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
143 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
156 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  49.29 
 
 
150 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 
145 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  46.58 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  51.22 
 
 
160 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 
145 aa  137  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 
145 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 
145 aa  137  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 
145 aa  137  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.63 
 
 
149 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 
163 aa  136  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 
145 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 
142 aa  136  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 
143 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  51.22 
 
 
203 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  51.67 
 
 
181 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 
143 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  51.67 
 
 
181 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  51.67 
 
 
149 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  51.67 
 
 
149 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  51.67 
 
 
149 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  51.67 
 
 
149 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  48.84 
 
 
150 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  45.99 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  49.19 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  45.52 
 
 
147 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 
147 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 
149 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  45.8 
 
 
136 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 
137 aa  126  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  46.62 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  43.57 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  51.33 
 
 
125 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 
155 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  44.06 
 
 
143 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
149 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  44.36 
 
 
137 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 
138 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  45.53 
 
 
150 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 
143 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 
150 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  40 
 
 
145 aa  115  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  36.6 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  39.74 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
146 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  32.03 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  35.48 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.58 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
292 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
286 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  28.33 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  31.3 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  26.36 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  29.55 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>