252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0100 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1815  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.42 
 
 
492 aa  682  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380425  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0100  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  100 
 
 
479 aa  947  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0109  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  100 
 
 
479 aa  947  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0727  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  91.17 
 
 
479 aa  802  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.99 
 
 
471 aa  706  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0548  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  78.68 
 
 
482 aa  713  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.24 
 
 
468 aa  685  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.04177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0090  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  100 
 
 
479 aa  947  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.190826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0119  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  91.17 
 
 
479 aa  790  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0192  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.64 
 
 
473 aa  728  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1723  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.84 
 
 
491 aa  650  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07830  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  66.32 
 
 
472 aa  628  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  70.43 
 
 
462 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  70.43 
 
 
462 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  70.43 
 
 
462 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  70.43 
 
 
462 aa  624  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  70.43 
 
 
462 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  70.43 
 
 
462 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  70.43 
 
 
462 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  70.43 
 
 
462 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  70.43 
 
 
462 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0904  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  68.91 
 
 
463 aa  614  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278692  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0233  pyridine nucleotide transhydrogenase  66.8 
 
 
486 aa  615  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1580  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.72 
 
 
462 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339018  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1648  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.72 
 
 
462 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250723  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1861  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.51 
 
 
462 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1589  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.72 
 
 
462 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.984324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1694  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.72 
 
 
462 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00431675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  69 
 
 
464 aa  606  1e-172  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  66.13 
 
 
494 aa  606  1e-172  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  67.23 
 
 
469 aa  604  1e-172  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  69 
 
 
464 aa  606  1e-172  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  69 
 
 
464 aa  606  1e-172  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2245  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  68.6 
 
 
468 aa  603  1e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.24 
 
 
494 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.24 
 
 
494 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  66.74 
 
 
458 aa  599  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2079  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.63 
 
 
457 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1850  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.09 
 
 
462 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513378  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.24 
 
 
494 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.82 
 
 
458 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.66801e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0942  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.71 
 
 
494 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3418  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.71 
 
 
494 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0951  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.71 
 
 
494 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  68.17 
 
 
458 aa  597  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0917  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.71 
 
 
494 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2266  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  64.71 
 
 
462 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.366293 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  67.53 
 
 
464 aa  597  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.91 
 
 
494 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2107  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.09 
 
 
462 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1784  pyridine nucleotide transhydrogenase  65.67 
 
 
469 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2584  pyridine nucleotide transhydrogenase  68.72 
 
 
464 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2400  pyridine nucleotide transhydrogenase  67.87 
 
 
462 aa  586  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1077  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  67.24 
 
 
480 aa  582  1e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  66.74 
 
 
458 aa  579  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3195  pyridine nucleotide transhydrogenase  63.53 
 
 
494 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0930  pyridine nucleotide transhydrogenase  64.57 
 
 
494 aa  579  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.339922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  64.14 
 
 
466 aa  577  1e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1862  pyridine nucleotide transhydrogenase  66.95 
 
 
462 aa  573  1e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.534712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.4 
 
 
466 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.61 
 
 
481 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2784  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.52 
 
 
472 aa  540  1e-152  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.37 
 
 
465 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.28 
 
 
470 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.7 
 
 
471 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.51 
 
 
482 aa  516  1e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.47 
 
 
467 aa  516  1e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3899  NAD(P)+ transhydrogenase beta chain  59.02 
 
 
477 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0665157  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.44 
 
 
470 aa  507  1e-142  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4666  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.23 
 
 
465 aa  508  1e-142  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  61.46 
 
 
475 aa  504  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.25 
 
 
471 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0707  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.9 
 
 
477 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.769172 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1581  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.04 
 
 
482 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1882  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.46 
 
 
482 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0239  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  58.46 
 
 
482 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.993412  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.65 
 
 
470 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4047  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.35 
 
 
479 aa  494  1e-138  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.754185  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2278  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.66 
 
 
466 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.314392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1234  NAD(P)(+) transhydrogenase  56.16 
 
 
498 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2491  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.63 
 
 
480 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3281  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  54.31 
 
 
502 aa  471  1e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.8 
 
 
466 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.9 
 
 
466 aa  441  1e-122  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.62 
 
 
467 aa  439  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  53.65 
 
 
465 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.47 
 
 
472 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  50.96 
 
 
478 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.81 
 
 
470 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.38 
 
 
488 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  50.96 
 
 
478 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.38 
 
 
488 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.05 
 
 
484 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.38 
 
 
489 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.86 
 
 
470 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.84 
 
 
493 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  50 
 
 
490 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.89 
 
 
484 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.48 
 
 
486 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.05 
 
 
484 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>