125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0097 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
266 aa  526  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
266 aa  526  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
266 aa  526  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  75.94 
 
 
266 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  75.56 
 
 
266 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  55.15 
 
 
276 aa  268  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  35.23 
 
 
250 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  34.81 
 
 
270 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  35.14 
 
 
265 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
270 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  27.92 
 
 
260 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  32.71 
 
 
265 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  35.71 
 
 
315 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  33.84 
 
 
295 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  27.97 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  32.34 
 
 
637 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  29.47 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  33.08 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  33.21 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  28.81 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.59 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  29.59 
 
 
340 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  29.32 
 
 
339 aa  85.9  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  32.08 
 
 
257 aa  85.1  1e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  25.59 
 
 
267 aa  84.3  2e-15  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.26573e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  29.41 
 
 
266 aa  84  2e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  28.62 
 
 
636 aa  84.3  2e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  29.21 
 
 
342 aa  84.3  2e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  29.59 
 
 
340 aa  83.6  3e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  32.45 
 
 
249 aa  83.6  3e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  2.2841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.21 
 
 
340 aa  83.2  4e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  30.51 
 
 
257 aa  83.2  4e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  32.53 
 
 
265 aa  82.8  6e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.21 
 
 
340 aa  82  8e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.21 
 
 
340 aa  82  8e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.76 
 
 
340 aa  81.3  1e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
262 aa  82  1e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  5.42198e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.24 
 
 
339 aa  81.6  1e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 
260 aa  81.6  1e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.24 
 
 
339 aa  81.3  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  30.9 
 
 
256 aa  80.1  3e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  28.63 
 
 
260 aa  80.1  3e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  30.48 
 
 
265 aa  80.1  4e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  29.43 
 
 
252 aa  79.7  5e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  36.02 
 
 
345 aa  79  7e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  26.94 
 
 
298 aa  78.6  1e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  29 
 
 
671 aa  78.6  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  28.1 
 
 
316 aa  77.8  2e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  31.23 
 
 
260 aa  77.4  2e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
279 aa  76.6  4e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  28.23 
 
 
260 aa  76.3  4e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  26.04 
 
 
260 aa  76.3  4e-13  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  31.02 
 
 
264 aa  75.9  6e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  26.02 
 
 
258 aa  75.9  6e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.45544e-11 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  26.72 
 
 
306 aa  75.1  1e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  29.07 
 
 
254 aa  74.3  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  25 
 
 
263 aa  74.3  2e-12  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  31.69 
 
 
256 aa  74.3  2e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  31.44 
 
 
316 aa  73.9  3e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  9.29077e-06 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  26.44 
 
 
292 aa  72.8  5e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 
250 aa  72.4  7e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  32.33 
 
 
302 aa  72.4  8e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  31.09 
 
 
247 aa  71.2  1e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  23.31 
 
 
332 aa  71.6  1e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  27.17 
 
 
239 aa  71.2  2e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  28.74 
 
 
260 aa  70.9  2e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  27.24 
 
 
250 aa  70.9  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  33.71 
 
 
302 aa  70.1  3e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  26.69 
 
 
267 aa  70.1  4e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.01238e-07  hitchhiker  4.8511e-11 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  25.3 
 
 
269 aa  69.3  6e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  24 
 
 
319 aa  69.3  6e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.63 
 
 
253 aa  68.6  1e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  31.66 
 
 
275 aa  68.6  1e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  28.93 
 
 
280 aa  68.6  1e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  29.15 
 
 
299 aa  67.8  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
246 aa  67.4  2e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 
262 aa  67.4  2e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  2.23295e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  31.42 
 
 
250 aa  67  3e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  27.44 
 
 
277 aa  66.2  5e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  38.46 
 
 
276 aa  66.2  5e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  31.5 
 
 
261 aa  65.1  1e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 
273 aa  65.1  1e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  37.14 
 
 
279 aa  65.1  1e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  24.24 
 
 
238 aa  63.5  3e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  28.47 
 
 
243 aa  63.9  3e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  29.6 
 
 
251 aa  62.8  6e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  62.4  7e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
265 aa  62.4  8e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  26.59 
 
 
243 aa  62  9e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 
321 aa  60.8  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  29.59 
 
 
344 aa  60.5  3e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  21.51 
 
 
264 aa  60.1  4e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  31.73 
 
 
244 aa  60.1  4e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  29.81 
 
 
274 aa  59.7  5e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  31.85 
 
 
354 aa  57.8  2e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  31.34 
 
 
263 aa  57  3e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 
262 aa  56.6  4e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 
245 aa  55.5  9e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>