22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0095 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  98.75 
 
 
160 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0112  hypothetical protein  68.75 
 
 
161 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0737  hypothetical protein  63.75 
 
 
161 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4044  protein of unknown function DUF456  42.95 
 
 
159 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1532  hypothetical protein  52.45 
 
 
163 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0624636  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16000  Protein of unknown function (DUF456)  42.96 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148783  normal  0.0914905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2960  hypothetical protein  50.98 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0664  hypothetical protein  37.66 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  40.52 
 
 
158 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27270  Protein of unknown function (DUF456)  38.67 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236002  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0722  hypothetical protein  40.12 
 
 
159 aa  80.5  9e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  35.53 
 
 
166 aa  80.1  1e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19890  hypothetical protein  36.43 
 
 
165 aa  67  1e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.649353  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28240  hypothetical protein  43.8 
 
 
160 aa  65.1  4e-10  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1497  hypothetical protein  41.88 
 
 
220 aa  63.9  9e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3772  protein of unknown function DUF456  29.87 
 
 
167 aa  59.7  2e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2540  protein of unknown function DUF456  40.16 
 
 
164 aa  58.9  3e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.658317  normal  0.52211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4908  hypothetical protein  40.31 
 
 
161 aa  50.4  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.417496  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  29.53 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  25.95 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>