134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0089 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  530  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  100 
 
 
263 aa  530  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0079  putative methyltransferase  99.24 
 
 
263 aa  524  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.331361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  40.98 
 
 
317 aa  141  1e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  40.36 
 
 
304 aa  140  2e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  40.81 
 
 
304 aa  140  2e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  40.81 
 
 
304 aa  140  2e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  38.29 
 
 
309 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  43.96 
 
 
309 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  41.4 
 
 
301 aa  136  3e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  37.61 
 
 
308 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  47.59 
 
 
314 aa  134  1e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  46.67 
 
 
307 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  37.18 
 
 
308 aa  132  7e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  37.18 
 
 
308 aa  132  7e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  41.78 
 
 
348 aa  131  1e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  48.63 
 
 
307 aa  130  2e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  41.21 
 
 
249 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10147  hypothetical protein  50.38 
 
 
310 aa  129  5e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  40 
 
 
306 aa  129  7e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  40.66 
 
 
249 aa  128  7e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  40.66 
 
 
242 aa  128  7e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  42.22 
 
 
246 aa  128  1e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  46.9 
 
 
300 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  44.87 
 
 
308 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  46.9 
 
 
300 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  46.9 
 
 
300 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  47.14 
 
 
312 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  53.24 
 
 
312 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  40.86 
 
 
367 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  53.24 
 
 
312 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  42.78 
 
 
310 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  42.76 
 
 
283 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  53.38 
 
 
312 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  41.15 
 
 
297 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10288  hypothetical protein  46.1 
 
 
302 aa  121  1e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59683e-26  normal  0.455495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  41.9 
 
 
297 aa  121  1e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  41.9 
 
 
297 aa  121  1e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  38.05 
 
 
278 aa  120  2e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  39.45 
 
 
301 aa  119  4e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.03136e-14  hitchhiker  1.40012e-07 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  44.52 
 
 
305 aa  117  1e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  44.2 
 
 
318 aa  117  1e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  45.39 
 
 
295 aa  117  2e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  36.57 
 
 
325 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2708  methyltransferase  38.74 
 
 
301 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  46.04 
 
 
298 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  39.81 
 
 
303 aa  111  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  43.65 
 
 
305 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3182  methyltransferase  40.54 
 
 
313 aa  108  9e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  45.04 
 
 
312 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  45.54 
 
 
301 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  42.22 
 
 
304 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0738  putative methyltransferase  45 
 
 
245 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  43.07 
 
 
313 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  44.93 
 
 
291 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  34.62 
 
 
798 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  33.52 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  37.8 
 
 
298 aa  89  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  31.84 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  31.52 
 
 
329 aa  84.7  1e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  38.38 
 
 
291 aa  84.7  1e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  30.33 
 
 
311 aa  78.2  1e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  34.04 
 
 
297 aa  72.4  6e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  34.81 
 
 
310 aa  72  1e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.06694e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  31.02 
 
 
307 aa  70.1  3e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  36.3 
 
 
306 aa  68.2  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  36.96 
 
 
286 aa  65.1  1e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  36.96 
 
 
286 aa  65.1  1e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2234  methyltransferase  33.14 
 
 
276 aa  65.1  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0473874  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  30.26 
 
 
287 aa  63.9  3e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  30.26 
 
 
287 aa  63.2  4e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  26.97 
 
 
209 aa  63.2  4e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  30.26 
 
 
287 aa  63.2  4e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  27.51 
 
 
301 aa  62  9e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  27.32 
 
 
295 aa  61.6  1e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  34.56 
 
 
276 aa  58.2  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  32.61 
 
 
285 aa  57  3e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  35.85 
 
 
285 aa  56.2  5e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  35.24 
 
 
285 aa  54.7  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  31.43 
 
 
285 aa  53.9  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  34.95 
 
 
292 aa  53.9  2e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  33.96 
 
 
292 aa  54.7  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
648 aa  54.7  2e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2212  putative methyltransferase  29.17 
 
 
285 aa  53.5  3e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26560  predicted protein  28.99 
 
 
219 aa  53.9  3e-06  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00221113 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
604 aa  53.5  3e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  33.96 
 
 
293 aa  53.5  4e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
659 aa  53.5  4e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3997  putative methyltransferase  29.38 
 
 
288 aa  53.1  5e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263514  normal  0.13197 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  33.02 
 
 
285 aa  52.8  5e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5836  putative methyltransferase  30.59 
 
 
282 aa  52.4  7e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11917  hypothetical protein  54.76 
 
 
118 aa  52.8  7e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  32.85 
 
 
290 aa  52.4  8e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  33.33 
 
 
285 aa  52  9e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
286 aa  52  9e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
604 aa  50.8  2e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
604 aa  50.8  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
630 aa  50.8  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
630 aa  50.8  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
604 aa  50.8  2e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>