135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0088 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  100 
 
 
312 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  99.04 
 
 
312 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  70 
 
 
309 aa  405  1e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  70.1 
 
 
309 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10147  hypothetical protein  64.72 
 
 
310 aa  358  5e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  53.67 
 
 
317 aa  284  1e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  49.36 
 
 
314 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  48.68 
 
 
305 aa  245  7e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  48.59 
 
 
312 aa  244  1e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  50.9 
 
 
304 aa  244  1e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  45.95 
 
 
307 aa  243  2e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  51.76 
 
 
301 aa  243  4e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  50.18 
 
 
304 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  50.18 
 
 
304 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  49.65 
 
 
306 aa  239  6e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  46.48 
 
 
348 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  44.83 
 
 
325 aa  233  2e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  45.16 
 
 
300 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  45.16 
 
 
300 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  45.16 
 
 
300 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  46.6 
 
 
301 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.03136e-14  hitchhiker  1.40012e-07 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  48.57 
 
 
367 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  50.72 
 
 
297 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  46.38 
 
 
307 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  50 
 
 
297 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  50 
 
 
297 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10288  hypothetical protein  46.91 
 
 
302 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59683e-26  normal  0.455495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  46.67 
 
 
308 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  46.67 
 
 
308 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  46.67 
 
 
308 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  46.25 
 
 
310 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  46.45 
 
 
308 aa  220  2e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  44.01 
 
 
303 aa  218  8e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  47.83 
 
 
305 aa  215  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  45.34 
 
 
318 aa  211  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  51.79 
 
 
301 aa  200  2e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  46.7 
 
 
295 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  40.85 
 
 
278 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  38.1 
 
 
283 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  42.47 
 
 
291 aa  164  2e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  39.07 
 
 
298 aa  162  5e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  34.93 
 
 
249 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  34.93 
 
 
242 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  34.93 
 
 
249 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2708  methyltransferase  36.86 
 
 
301 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  42.23 
 
 
246 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  35.9 
 
 
279 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  34.68 
 
 
304 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0079  putative methyltransferase  44.71 
 
 
263 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.331361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  44.71 
 
 
263 aa  142  1e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  44.71 
 
 
263 aa  142  1e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  40.91 
 
 
313 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  42.36 
 
 
291 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  34.36 
 
 
312 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  35.89 
 
 
798 aa  129  8e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3182  methyltransferase  36.09 
 
 
313 aa  125  8e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0738  putative methyltransferase  43.78 
 
 
245 aa  118  2e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  32.79 
 
 
329 aa  116  4e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  26.45 
 
 
295 aa  83.2  6e-15  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  39.53 
 
 
298 aa  82.4  8e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30355  predicted protein  33.67 
 
 
260 aa  82  1e-14  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  29.71 
 
 
297 aa  80.5  3e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11917  hypothetical protein  47.86 
 
 
118 aa  77.4  3e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  28.31 
 
 
306 aa  76.6  5e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  32.67 
 
 
306 aa  75.5  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  28.17 
 
 
311 aa  73.9  3e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
659 aa  72.8  7e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  38.76 
 
 
285 aa  72.4  8e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
604 aa  72.4  8e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1534  methyltransferase  29.6 
 
 
301 aa  72.4  8e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  26.11 
 
 
310 aa  69.7  6e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.06694e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  37.12 
 
 
287 aa  68.6  1e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  37.12 
 
 
287 aa  68.2  2e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  37.12 
 
 
287 aa  68.2  2e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  38.64 
 
 
286 aa  67.4  3e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
604 aa  67.8  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
604 aa  67.8  3e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
604 aa  67.4  3e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
630 aa  67.4  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
630 aa  67.4  3e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  38.64 
 
 
286 aa  67.4  3e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  25.96 
 
 
291 aa  67  4e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0683  methyltransferase  31.87 
 
 
285 aa  66.6  5e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  36.36 
 
 
285 aa  66.2  6e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  36.09 
 
 
292 aa  65.1  2e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  32.37 
 
 
293 aa  64.3  3e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  31.88 
 
 
292 aa  62.8  7e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
639 aa  62.8  7e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  30.87 
 
 
307 aa  62.8  8e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  26.88 
 
 
209 aa  62.8  8e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0649  methyltransferase  35.56 
 
 
283 aa  62.4  9e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
648 aa  60.8  3e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
286 aa  60.5  4e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  31.63 
 
 
286 aa  59.7  6e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  36.36 
 
 
286 aa  59.3  9e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  36.36 
 
 
286 aa  59.3  9e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
286 aa  59.3  9e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  36.36 
 
 
286 aa  59.3  9e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  36.36 
 
 
286 aa  59.3  9e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>