158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0086 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  98.54 
 
 
205 aa  416  1e-115  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 
188 aa  255  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  64.32 
 
 
188 aa  253  2e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 
187 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  47.97 
 
 
215 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
207 aa  83.2  2e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
186 aa  81.3  1e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
238 aa  73.2  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  31.1 
 
 
238 aa  73.6  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  31.1 
 
 
238 aa  73.2  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  31.1 
 
 
238 aa  73.2  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
238 aa  73.2  2e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
238 aa  73.2  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
188 aa  71.6  7e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
211 aa  71.2  9e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
188 aa  71.2  1e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
192 aa  69.7  3e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
180 aa  68.6  6e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
187 aa  68.2  9e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
205 aa  62.4  4e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
213 aa  62  5e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
180 aa  61.6  7e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 
210 aa  61.6  7e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
187 aa  61.2  9e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
182 aa  60.5  2e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 
209 aa  59.7  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
177 aa  59.3  4e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
206 aa  58.9  5e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 
185 aa  58.5  6e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
199 aa  58.5  6e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
211 aa  58.5  7e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
211 aa  58.5  7e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
211 aa  58.5  7e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
187 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  28.66 
 
 
191 aa  56.6  2e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
186 aa  57  2e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  25.16 
 
 
208 aa  55.8  4e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  25 
 
 
182 aa  53.5  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
212 aa  52.8  4e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
212 aa  52.8  4e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  52.4  5e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
212 aa  52.4  5e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
211 aa  52  6e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
214 aa  52  6e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
184 aa  52  7e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 
184 aa  51.6  8e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
188 aa  51.6  8e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
212 aa  51.6  9e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  23.42 
 
 
198 aa  50.8  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  30.65 
 
 
207 aa  51.2  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  31.07 
 
 
186 aa  50.4  2e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 
208 aa  50.4  2e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
216 aa  50.1  2e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
231 aa  50.1  2e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  29.92 
 
 
205 aa  50.1  2e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.84066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
179 aa  49.7  3e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  23.97 
 
 
189 aa  48.9  5e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
194 aa  48.5  6e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
194 aa  48.9  6e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
214 aa  48.9  6e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
186 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
186 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.24065e-08 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  28.89 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
200 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 
217 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
194 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  26.74 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.20531e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  38.6 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  22.33 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
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NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
332 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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