More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0084 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  100 
 
 
328 aa  661  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  661  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  661  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  85.49 
 
 
324 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  79.63 
 
 
324 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  76 
 
 
323 aa  514  1e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  69.75 
 
 
322 aa  465  1e-130  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  69.63 
 
 
322 aa  459  1e-128  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  65.86 
 
 
346 aa  421  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  64.78 
 
 
315 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  61.85 
 
 
331 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  2.48585e-05 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  63.32 
 
 
342 aa  407  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  60.06 
 
 
328 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  59.08 
 
 
337 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  56.52 
 
 
320 aa  362  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  52.6 
 
 
318 aa  304  2e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  44.26 
 
 
290 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  43.33 
 
 
292 aa  236  5e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  44.41 
 
 
290 aa  234  1e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  44.37 
 
 
290 aa  234  2e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  44.72 
 
 
290 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  44.37 
 
 
290 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  43.66 
 
 
290 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  44.01 
 
 
290 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  44.01 
 
 
290 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  39.68 
 
 
337 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  40.27 
 
 
292 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  40.48 
 
 
290 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  40.48 
 
 
290 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  40.48 
 
 
290 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  39.93 
 
 
290 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  39.93 
 
 
290 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  39.93 
 
 
290 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  39.93 
 
 
287 aa  202  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  39.39 
 
 
286 aa  201  1e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  42 
 
 
290 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
288 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
288 aa  198  1e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  41.61 
 
 
288 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
288 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  40.4 
 
 
288 aa  196  4e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  41.61 
 
 
288 aa  196  5e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  40.74 
 
 
288 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  40.85 
 
 
293 aa  190  3e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  39.73 
 
 
288 aa  190  3e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  39.41 
 
 
305 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  40.49 
 
 
288 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  42.19 
 
 
293 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  38.18 
 
 
286 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  37.84 
 
 
286 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  39.39 
 
 
288 aa  184  1e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  37.84 
 
 
286 aa  184  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  37.84 
 
 
286 aa  184  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  36.82 
 
 
292 aa  184  2e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  40.27 
 
 
288 aa  184  2e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  37.5 
 
 
286 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  38.85 
 
 
293 aa  182  9e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  39.06 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  39.06 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  39.06 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  39.06 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  35.47 
 
 
293 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  37.92 
 
 
293 aa  180  3e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  41.11 
 
 
288 aa  180  3e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  38.72 
 
 
288 aa  180  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  38.72 
 
 
288 aa  180  3e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  38.87 
 
 
290 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  39.3 
 
 
286 aa  179  6e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  37.79 
 
 
299 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  37.84 
 
 
285 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  37.46 
 
 
286 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  37.5 
 
 
285 aa  175  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  37.25 
 
 
289 aa  174  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  39.08 
 
 
288 aa  174  2e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  37.25 
 
 
289 aa  174  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  37.25 
 
 
289 aa  174  2e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  39.51 
 
 
287 aa  173  4e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  36.45 
 
 
303 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  34.8 
 
 
284 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  35.45 
 
 
289 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  38.11 
 
 
295 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  37.07 
 
 
294 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  38.87 
 
 
283 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  37.68 
 
 
286 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  35.71 
 
 
283 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  37.54 
 
 
295 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  37.54 
 
 
298 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  36.75 
 
 
286 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  35.71 
 
 
301 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  32.76 
 
 
289 aa  168  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  35.35 
 
 
282 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  35.91 
 
 
293 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  35.12 
 
 
287 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 
295 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  36.59 
 
 
298 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  36.61 
 
 
290 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  37 
 
 
299 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  36.05 
 
 
274 aa  166  7e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  36.31 
 
 
303 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>