162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0072 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  958  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  958  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  99.37 
 
 
475 aa  951  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  74.79 
 
 
455 aa  643  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  73.32 
 
 
463 aa  614  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  69.28 
 
 
666 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.65263e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  44.48 
 
 
425 aa  259  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  39.12 
 
 
495 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  43.3 
 
 
405 aa  235  1e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  40.33 
 
 
418 aa  234  2e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  41.26 
 
 
478 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  38.74 
 
 
388 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  38.74 
 
 
388 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  38.74 
 
 
388 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  39.22 
 
 
771 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  41.26 
 
 
343 aa  221  2e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  39.39 
 
 
639 aa  214  2e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  37.24 
 
 
364 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  37.1 
 
 
362 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  38.46 
 
 
665 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  36.73 
 
 
899 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  40.31 
 
 
759 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  38.46 
 
 
698 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  38.46 
 
 
619 aa  196  8e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  37.84 
 
 
346 aa  184  2e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  40.07 
 
 
330 aa  182  9e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.08 
 
 
552 aa  173  6e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  31.08 
 
 
414 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  33.51 
 
 
416 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.47 
 
 
412 aa  159  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  34.13 
 
 
453 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.57 
 
 
532 aa  153  6e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  30.45 
 
 
587 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  31.93 
 
 
390 aa  143  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  34.02 
 
 
319 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  34.02 
 
 
319 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  34.02 
 
 
319 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  35.19 
 
 
1160 aa  133  7e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  33.57 
 
 
390 aa  132  1e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  31.27 
 
 
341 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  30.41 
 
 
579 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  31.76 
 
 
926 aa  119  1e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  32.37 
 
 
544 aa  118  2e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  31.8 
 
 
380 aa  115  1e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  31.18 
 
 
968 aa  112  1e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  30.41 
 
 
1519 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  29.45 
 
 
1132 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  27.53 
 
 
586 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  4.55541e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  26.16 
 
 
533 aa  96.7  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.64 
 
 
542 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  26.32 
 
 
811 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  24.91 
 
 
534 aa  75.5  2e-12  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  29.9 
 
 
478 aa  75.5  2e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  25.42 
 
 
439 aa  73.2  9e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  26.02 
 
 
617 aa  71.2  3e-11  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  27.78 
 
 
485 aa  71.2  4e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  28.16 
 
 
497 aa  70.5  7e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  27.39 
 
 
474 aa  68.9  2e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  26.29 
 
 
487 aa  66.6  1e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  25.33 
 
 
494 aa  63.5  8e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25.67 
 
 
334 aa  62  2e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.68 
 
 
253 aa  57.8  4e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
278 aa  54.7  3e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
256 aa  53.9  6e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.76 
 
 
254 aa  53.5  8e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0348907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.14 
 
 
294 aa  52.8  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.14 
 
 
294 aa  52.8  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 
278 aa  53.1  1e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.88 
 
 
261 aa  53.1  1e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0431  carbon-monoxide dehydrogenase accessory protein  30.67 
 
 
253 aa  52.8  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118892  normal  0.958218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  38.33 
 
 
256 aa  52.4  2e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  31.84 
 
 
370 aa  52  2e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.07 
 
 
289 aa  52  2e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 
250 aa  51.6  3e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  8.22608e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.13 
 
 
269 aa  51.2  4e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.97 
 
 
259 aa  50.4  7e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
343 aa  50.1  8e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
254 aa  50.1  9e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  23.18 
 
 
659 aa  50.1  9e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.03 
 
 
304 aa  50.1  9e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.02 
 
 
257 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.36624e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1199  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.88 
 
 
249 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  33.6 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.6 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.6 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.6 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  33.6 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  33.6 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.6 
 
 
256 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 
268 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  27.06 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.22 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  1.01821e-05 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 
298 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.88 
 
 
264 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.44 
 
 
397 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  32.17 
 
 
251 aa  47  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.94 
 
 
304 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  35.35 
 
 
219 aa  47  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.1 
 
 
222 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.69 
 
 
266 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>