70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0069 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0069  PPE protein  100 
 
 
443 aa  861  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0078  PPE protein  100 
 
 
443 aa  861  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.6171  normal  0.0155913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0059  PPE protein  99.1 
 
 
443 aa  854  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0768  PPE protein  56.73 
 
 
436 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0077  PPE protein  57.08 
 
 
439 aa  363  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.150251  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  43.9 
 
 
368 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5459  PPE protein  45.83 
 
 
450 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.785537  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5559  PPE protein  36.08 
 
 
452 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67535  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5962  PPE protein  36.08 
 
 
452 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  43.68 
 
 
435 aa  129  1e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  43.68 
 
 
434 aa  129  1e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  40 
 
 
445 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  45.36 
 
 
540 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  44.87 
 
 
556 aa  115  1e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0415  PPE protein  49.68 
 
 
524 aa  114  4e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  41.18 
 
 
518 aa  109  9e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0374  PPE protein  45.73 
 
 
525 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0363  PPE protein  45.73 
 
 
525 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0384  PPE protein  45.73 
 
 
525 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  44.87 
 
 
513 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12155  PPE family protein  41.48 
 
 
496 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.649845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  39.75 
 
 
539 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.93928e-11  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  44.59 
 
 
463 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  42.21 
 
 
536 aa  94  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  38.79 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  39.07 
 
 
396 aa  82  2e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  41.76 
 
 
350 aa  82  2e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  41.76 
 
 
350 aa  81.3  4e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  31.46 
 
 
391 aa  80.1  7e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  37.63 
 
 
380 aa  78.2  3e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  38.46 
 
 
391 aa  77.8  4e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  37.75 
 
 
392 aa  76.3  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  38.5 
 
 
394 aa  76.3  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  39.61 
 
 
406 aa  75.1  2e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  8.59509e-09 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13770  PPE family protein  47.83 
 
 
315 aa  73.9  5e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  38.92 
 
 
403 aa  73.9  5e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  38.93 
 
 
443 aa  72.8  1e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.54935e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  37.77 
 
 
463 aa  71.2  3e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1557e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  42 
 
 
408 aa  68.2  3e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  37.95 
 
 
385 aa  68.2  3e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  38.41 
 
 
382 aa  66.2  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  41.89 
 
 
394 aa  66.2  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  31.43 
 
 
346 aa  65.9  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  42.11 
 
 
391 aa  65.9  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5056  PPE family protein  49.16 
 
 
382 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  41.4 
 
 
413 aa  65.5  2e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  30.07 
 
 
194 aa  62  2e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4671  PPE family protein  48.04 
 
 
382 aa  60.8  4e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535687  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4757  PPE family protein  48.04 
 
 
382 aa  60.8  4e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  35.47 
 
 
3295 aa  60.8  4e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  36.31 
 
 
470 aa  60.8  5e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  38.28 
 
 
580 aa  59.7  9e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.2358e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  40.54 
 
 
393 aa  58.5  2e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  33.72 
 
 
760 aa  58.9  2e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  33.85 
 
 
213 aa  57.8  4e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  35.29 
 
 
423 aa  54.3  4e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  44 
 
 
448 aa  53.5  7e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  37.14 
 
 
391 aa  51.6  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  39.47 
 
 
582 aa  51.2  4e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  7.13233e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  35.71 
 
 
409 aa  50.1  8e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  33.92 
 
 
655 aa  50.1  9e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13771  PPE family protein  42.47 
 
 
77 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  41.3 
 
 
590 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  32.45 
 
 
645 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  36.77 
 
 
551 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.28496e-05  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  39.19 
 
 
1013 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  34.67 
 
 
1457 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  35.33 
 
 
3166 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  41.07 
 
 
975 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  1.53091e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  30.91 
 
 
487 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>