18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0062 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0062  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  573  1e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0071  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  573  1e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0926033  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0052  hypothetical protein  99.65 
 
 
282 aa  570  1e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0070  hypothetical protein  75.47 
 
 
283 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0604808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0775  hypothetical protein  70.44 
 
 
308 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13901  hypothetical protein  67.77 
 
 
283 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0378  putative DNA-binding protein  28.41 
 
 
314 aa  66.6  4e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10296  hypothetical protein  27.7 
 
 
295 aa  66.6  4e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.50077e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0387  putative DNA-binding protein  28.41 
 
 
314 aa  66.6  4e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.609186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0366  putative DNA-binding protein  28.41 
 
 
314 aa  65.5  9e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0419  putative DNA-binding protein  27.34 
 
 
286 aa  60.5  3e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.327919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3645  hypothetical protein  25.23 
 
 
275 aa  59.7  5e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5539  hypothetical protein  26.91 
 
 
280 aa  52.4  8e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  24.7 
 
 
272 aa  51.6  1e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0322  putative DNA-binding protein  25.46 
 
 
290 aa  50.1  4e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300719  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0330  hypothetical protein  25.27 
 
 
287 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5969  putative DNA-binding protein  24.72 
 
 
276 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977885  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5566  putative DNA-binding protein  24.72 
 
 
276 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.777934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>