23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0056 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0056  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  230  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0485848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0065  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  230  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425042  normal  0.0470908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0046  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  230  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.884886  hitchhiker  0.00802794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0782  hypothetical protein  60 
 
 
89 aa  112  2e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0065  hypothetical protein  56.47 
 
 
89 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  41.25 
 
 
99 aa  68.6  3e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  48 
 
 
631 aa  65.1  3e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32410  hypothetical protein  46.34 
 
 
113 aa  63.9  6e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.763333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  47.5 
 
 
266 aa  48.9  2e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  47.5 
 
 
276 aa  47.8  6e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  47.5 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  45 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  45 
 
 
273 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  42.5 
 
 
274 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  42.5 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  42.5 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  42.5 
 
 
271 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  42.5 
 
 
272 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  45 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  45 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  45 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  48.48 
 
 
260 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  51.52 
 
 
254 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>