51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0053 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  540  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  540  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  540  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  57.95 
 
 
268 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  58.24 
 
 
268 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  53.05 
 
 
272 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  37.13 
 
 
277 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  36.88 
 
 
270 aa  145  7e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  36.88 
 
 
270 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  36.88 
 
 
270 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  33.6 
 
 
260 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3381  hypothetical protein  36.76 
 
 
277 aa  120  2e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981004  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  32.58 
 
 
285 aa  121  2e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  33.94 
 
 
284 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  33.85 
 
 
264 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  30.95 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  31.67 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  29.89 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  30.86 
 
 
262 aa  80.9  2e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  32.12 
 
 
258 aa  80.1  3e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  30.25 
 
 
257 aa  79.3  6e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  28.63 
 
 
270 aa  76.3  5e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  28.63 
 
 
270 aa  76.3  5e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  28.63 
 
 
262 aa  75.9  6e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  29.69 
 
 
280 aa  76.3  6e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  32.68 
 
 
268 aa  75.9  8e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  27.76 
 
 
270 aa  74.7  2e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  32.28 
 
 
268 aa  74.7  2e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  32.28 
 
 
268 aa  74.7  2e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  27.04 
 
 
269 aa  73.6  3e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  30.11 
 
 
263 aa  70.9  2e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  27.92 
 
 
276 aa  70.9  2e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  28.63 
 
 
268 aa  68.9  8e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  26.91 
 
 
267 aa  68.9  8e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  30.4 
 
 
267 aa  68.9  8e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  28.9 
 
 
256 aa  68.6  1e-10  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  26.29 
 
 
270 aa  67.4  3e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  31.13 
 
 
264 aa  66.6  4e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  30.08 
 
 
254 aa  65.5  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  32.87 
 
 
265 aa  62.4  8e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  29.89 
 
 
256 aa  60.8  2e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  27.24 
 
 
267 aa  55.8  7e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.9392e-10 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  30.68 
 
 
258 aa  54.3  2e-06  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  27.24 
 
 
267 aa  52  1e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  29.22 
 
 
276 aa  52  1e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  1.26361e-12 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  24.16 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  27.08 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  28.3 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>