118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0052 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  321  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  321  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  98.11 
 
 
159 aa  317  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  66.1 
 
 
119 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  50.62 
 
 
169 aa  162  2e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  51.23 
 
 
163 aa  160  8e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  6.49339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  43.42 
 
 
150 aa  129  1e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  43.42 
 
 
150 aa  129  1e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  43.42 
 
 
150 aa  129  2e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  41.21 
 
 
168 aa  127  7e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  124  4e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  39.49 
 
 
166 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  37.04 
 
 
134 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  37.96 
 
 
144 aa  101  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  40.82 
 
 
145 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  43.94 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  37.04 
 
 
133 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  35.42 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  41.3 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  40.58 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  40.58 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  39.06 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  37.04 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  43.64 
 
 
150 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  38.82 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  40.91 
 
 
145 aa  87.8  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  44.55 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  36.36 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  38.28 
 
 
311 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  36.62 
 
 
149 aa  84.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  83.6  1e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  34.03 
 
 
143 aa  83.2  1e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  39.69 
 
 
125 aa  83.2  1e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  38.18 
 
 
158 aa  82.8  2e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  41.01 
 
 
149 aa  82.8  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  39.01 
 
 
152 aa  80.5  8e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.72 
 
 
274 aa  79.7  1e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  38.89 
 
 
324 aa  79.3  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  32.84 
 
 
154 aa  79  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  35.61 
 
 
177 aa  79.3  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  79  3e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  35.71 
 
 
164 aa  78.6  3e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  36.55 
 
 
155 aa  78.6  4e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  35.85 
 
 
147 aa  78.2  4e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  34.07 
 
 
145 aa  77  9e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  35.03 
 
 
150 aa  77  1e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  38.3 
 
 
152 aa  76.6  1e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  37.8 
 
 
147 aa  76.3  2e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  34.9 
 
 
144 aa  75.5  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  40.32 
 
 
164 aa  73.6  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  34.07 
 
 
360 aa  72.4  2e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  35.96 
 
 
145 aa  72  3e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  36.45 
 
 
145 aa  72  3e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  34.91 
 
 
140 aa  72.4  3e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  36.45 
 
 
145 aa  72  3e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  36.7 
 
 
159 aa  72  3e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  33.08 
 
 
143 aa  71.2  6e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  36.8 
 
 
161 aa  70.9  6e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0176  hypothetical protein  35.81 
 
 
158 aa  70.9  6e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  36.45 
 
 
145 aa  70.9  7e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  36.05 
 
 
157 aa  70.9  7e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  70.1  1e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  35.51 
 
 
148 aa  70.1  1e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  37.38 
 
 
174 aa  69.3  2e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  33.8 
 
 
142 aa  68.6  3e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  33.12 
 
 
142 aa  68.9  3e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  33.12 
 
 
142 aa  68.9  3e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  68.9  3e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  30.23 
 
 
145 aa  68.6  3e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5096  hypothetical protein  30.11 
 
 
196 aa  67.8  5e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  67.4  7e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  67.4  7e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2072  hypothetical protein  31.88 
 
 
157 aa  67.4  7e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.0346147 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  34.81 
 
 
169 aa  67.4  7e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  34.51 
 
 
138 aa  67.4  7e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1823  hypothetical protein  31.13 
 
 
154 aa  67.4  8e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00900716  normal  0.0800566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  31.34 
 
 
157 aa  66.6  1e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  35.51 
 
 
146 aa  66.6  1e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3405  hypothetical protein  32.73 
 
 
164 aa  66.2  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.460418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  34.59 
 
 
144 aa  65.5  3e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  36.3 
 
 
164 aa  65.1  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  33.02 
 
 
143 aa  64.3  6e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  29.94 
 
 
149 aa  64.3  6e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0372  hypothetical protein  33.9 
 
 
150 aa  63.9  8e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  32.08 
 
 
140 aa  62.4  2e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0055  hypothetical protein  34.62 
 
 
117 aa  62.4  3e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  30.47 
 
 
168 aa  60.8  6e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  27.46 
 
 
157 aa  58.9  3e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  32.71 
 
 
146 aa  58.5  4e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.08 
 
 
306 aa  58.2  5e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5607  hypothetical protein  34.41 
 
 
176 aa  57.8  7e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2738  hypothetical protein  30.82 
 
 
155 aa  57  9e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0877362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  57  9e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0862  hypothetical protein  33.08 
 
 
202 aa  56.2  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.929714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>