58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0050 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0050  FHA domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0059  FHA domain-containing protein  100 
 
 
343 aa  664    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0562745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0040  FHA domain-containing protein  98.83 
 
 
343 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316626  normal  0.0320311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0068  hypothetical protein  39.53 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.279657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13898  hypothetical protein  33.69 
 
 
392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0777  hypothetical protein  41.67 
 
 
245 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593752  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5587  XRE family transcriptional regulator  37.85 
 
 
274 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0058  hypothetical protein  38.46 
 
 
243 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0067  hypothetical protein  38.46 
 
 
243 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  0.0477418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0048  hypothetical protein  38.46 
 
 
243 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119962  hitchhiker  0.009633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  37.89 
 
 
866 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  37.89 
 
 
866 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  37.89 
 
 
866 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  51.92 
 
 
158 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13396  hypothetical protein  33.77 
 
 
122 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0921482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  31.58 
 
 
869 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40 
 
 
557 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00230  FHA domain-containing protein  45.45 
 
 
163 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.62 
 
 
554 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  36.51 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  31.58 
 
 
861 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2047  Forkhead-associated protein  45.1 
 
 
814 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.445057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.62 
 
 
554 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.86 
 
 
606 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  36.84 
 
 
175 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3415  putative sigma54 specific transcriptional regulator  34.62 
 
 
554 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  40 
 
 
220 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  34.12 
 
 
238 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  40.32 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0032  FHA domain containing protein  34.15 
 
 
154 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  38.46 
 
 
245 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  42.31 
 
 
160 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1342  FHA domain containing protein  41.79 
 
 
137 aa  46.6  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  41.79 
 
 
234 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  33.82 
 
 
863 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  36.36 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1816  FHA domain-containing protein  46.03 
 
 
121 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  40.98 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  38.67 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  41.54 
 
 
121 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  34.94 
 
 
149 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  44.44 
 
 
121 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  39.68 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1797  FHA domain containing protein  47.27 
 
 
195 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00410  FHA domain-containing protein  35.82 
 
 
156 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  38.03 
 
 
169 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.23 
 
 
777 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0025  FHA domain-containing protein  32.88 
 
 
160 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
138 aa  43.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
242 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2551  FHA domain containing protein  36.59 
 
 
206 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2541  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
514 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.913197  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0026  FHA domain containing protein  35.59 
 
 
154 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  36.21 
 
 
154 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  40.62 
 
 
219 aa  42.7  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0030  Forkhead-associated protein  32.88 
 
 
153 aa  42.7  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.78 
 
 
878 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  45.28 
 
 
170 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>