100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0043 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  269  8e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  269  8e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  98.52 
 
 
135 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  73.48 
 
 
137 aa  193  5e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  70.54 
 
 
133 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  82  2e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  38.58 
 
 
142 aa  82  3e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  39.17 
 
 
140 aa  79.3  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  39.17 
 
 
140 aa  79  2e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  39.17 
 
 
140 aa  79  2e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  37.6 
 
 
146 aa  76.6  1e-13  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  34.96 
 
 
147 aa  73.2  1e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  35.29 
 
 
143 aa  73.2  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  36.44 
 
 
154 aa  72.4  2e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  39.34 
 
 
141 aa  68.9  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  36.59 
 
 
146 aa  68.6  3e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  39.84 
 
 
156 aa  68.2  4e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  37.1 
 
 
159 aa  67.8  5e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  35.07 
 
 
157 aa  67.4  6e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  31.78 
 
 
168 aa  66.2  1e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  35.94 
 
 
153 aa  66.2  1e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  32.52 
 
 
160 aa  65.1  3e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  62.8  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  34.17 
 
 
144 aa  62.4  2e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  32 
 
 
150 aa  62.4  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  61.2  4e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  34.68 
 
 
152 aa  61.2  5e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  34.4 
 
 
135 aa  60.8  6e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  59.7  1e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  28.79 
 
 
158 aa  58.5  3e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  32.17 
 
 
190 aa  58.9  3e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  33.87 
 
 
136 aa  57.4  6e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  33.87 
 
 
141 aa  57.4  7e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  28.69 
 
 
145 aa  57.4  7e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  33.87 
 
 
141 aa  57.4  7e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  32.56 
 
 
190 aa  55.8  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  9.07903e-10  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  27.41 
 
 
144 aa  55.1  4e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  34.31 
 
 
144 aa  54.3  5e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  29.66 
 
 
163 aa  54.3  6e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  32.31 
 
 
146 aa  53.9  8e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  34.88 
 
 
185 aa  53.1  1e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  26.67 
 
 
166 aa  53.1  1e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  32.8 
 
 
141 aa  52.8  1e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  29.69 
 
 
145 aa  53.1  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  29.84 
 
 
185 aa  52.4  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.5 
 
 
182 aa  52  2e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  52.5 
 
 
157 aa  52  3e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  31.75 
 
 
185 aa  51.6  4e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  30.65 
 
 
143 aa  51.6  4e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  50.8  6e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  30.95 
 
 
185 aa  50.8  6e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  30.4 
 
 
182 aa  50.8  7e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  34.43 
 
 
129 aa  50.4  8e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  35.77 
 
 
146 aa  50.4  8e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  32.58 
 
 
161 aa  50.1  1e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  35.29 
 
 
274 aa  49.7  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  34.38 
 
 
172 aa  48.9  2e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  33.9 
 
 
163 aa  48.9  2e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  33.61 
 
 
156 aa  49.3  2e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  26.12 
 
 
151 aa  47.8  5e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4591  hypothetical protein  36.3 
 
 
139 aa  47.4  7e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395893  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  28.46 
 
 
166 aa  47  9e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  27.66 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  33.9 
 
 
451 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  29.6 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  29.6 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  31.36 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  31.88 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  29.32 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  29.6 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  36.22 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  27.12 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  29.51 
 
 
168 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  26.83 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  26.83 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  26.83 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  29.69 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  35.23 
 
 
178 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  28.35 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  29.03 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4387  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  33.06 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2896  hypothetical protein  25.74 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  29.27 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  35.43 
 
 
133 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2879  hypothetical protein  28.79 
 
 
166 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494384  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  25.81 
 
 
181 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  28.79 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.15 
 
 
224 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  31.93 
 
 
358 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  26.52 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  24.26 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  24.43 
 
 
178 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  26.24 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  30.95 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  25.19 
 
 
177 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>