143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0042 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  280  4e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  280  4e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  97.83 
 
 
138 aa  274  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  85.71 
 
 
140 aa  242  1e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  84.44 
 
 
143 aa  236  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  44.36 
 
 
311 aa  118  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  103  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  81.3  4e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  36.89 
 
 
138 aa  79.7  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  31.39 
 
 
137 aa  77.4  6e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  32.56 
 
 
133 aa  76.6  1e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  35.4 
 
 
140 aa  76.6  1e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  31.45 
 
 
145 aa  75.5  2e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  35.07 
 
 
145 aa  75.5  2e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  30.65 
 
 
143 aa  75.5  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  32.58 
 
 
131 aa  75.1  3e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  34.15 
 
 
135 aa  74.3  5e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  30.3 
 
 
321 aa  73.9  7e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  72.4  2e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  31.78 
 
 
148 aa  72  2e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  72.8  2e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  30.43 
 
 
129 aa  72.4  2e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  37.19 
 
 
141 aa  72  3e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  28.57 
 
 
136 aa  71.2  5e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  36.36 
 
 
317 aa  70.5  6e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  36.8 
 
 
317 aa  68.9  2e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  35.07 
 
 
318 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  34.96 
 
 
146 aa  68.9  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  31.06 
 
 
137 aa  69.3  2e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  35 
 
 
149 aa  68.9  2e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  35.07 
 
 
318 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  30.3 
 
 
137 aa  68.2  3e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  30.66 
 
 
137 aa  68.2  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  32.17 
 
 
130 aa  67.8  5e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  30.3 
 
 
137 aa  67.8  5e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  29.91 
 
 
139 aa  67.8  5e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  35.14 
 
 
132 aa  66.2  1e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  36.94 
 
 
146 aa  66.2  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  33.06 
 
 
137 aa  66.2  1e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  66.2  1e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  66.6  1e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  32.17 
 
 
131 aa  65.5  2e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  35.77 
 
 
324 aa  65.5  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.46 
 
 
144 aa  65.5  2e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  36.28 
 
 
132 aa  65.5  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  31.62 
 
 
136 aa  65.5  2e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.95 
 
 
130 aa  65.1  3e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  31.09 
 
 
138 aa  65.1  3e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.93 
 
 
137 aa  64.7  4e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
333 aa  64.3  5e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  33.03 
 
 
132 aa  64.3  5e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.23569e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.07 
 
 
130 aa  63.9  7e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  30.17 
 
 
130 aa  63.5  9e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  37.08 
 
 
129 aa  63.2  1e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  32.26 
 
 
132 aa  63.5  1e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  29.41 
 
 
152 aa  63.2  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.41 
 
 
152 aa  62  2e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.21 
 
 
132 aa  62.8  2e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.41 
 
 
152 aa  62  2e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  38.38 
 
 
123 aa  62.8  2e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  33.61 
 
 
319 aa  62.4  2e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  37.36 
 
 
127 aa  61.6  3e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.79 
 
 
143 aa  61.6  3e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  37.36 
 
 
127 aa  61.6  4e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  31.45 
 
 
132 aa  61.6  4e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.82 
 
 
139 aa  60.8  6e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  30.63 
 
 
120 aa  60.5  7e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  31.5 
 
 
125 aa  60.5  9e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  27.45 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  27.45 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1027  hypothetical protein  28.46 
 
 
175 aa  59.3  2e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  27.45 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  27.45 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  27.45 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  27.45 
 
 
152 aa  59.3  2e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  58.5  3e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.2 
 
 
136 aa  58.5  3e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  31.58 
 
 
128 aa  57.8  5e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  32.43 
 
 
128 aa  57.8  5e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  33.62 
 
 
128 aa  57.8  5e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  5.82925e-06 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  32.82 
 
 
311 aa  57  9e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.09 
 
 
140 aa  56.2  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  32.09 
 
 
135 aa  56.6  1e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  56.6  1e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  36.45 
 
 
127 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.14 
 
 
152 aa  55.8  2e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  30.65 
 
 
132 aa  55.8  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  32.26 
 
 
176 aa  55.1  3e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  28.8 
 
 
132 aa  55.1  3e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  28.57 
 
 
132 aa  55.1  4e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  31.09 
 
 
132 aa  54.3  5e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  27.87 
 
 
140 aa  54.3  5e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  25.71 
 
 
135 aa  53.9  8e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  23.7 
 
 
141 aa  52.8  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.46433e-07  hitchhiker  6.44081e-06 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  30.48 
 
 
130 aa  52.8  2e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  27.68 
 
 
141 aa  52  3e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  36.52 
 
 
134 aa  52  3e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>