More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0041 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  822  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  99.75 
 
 
402 aa  818  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  87.06 
 
 
402 aa  679  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  87.56 
 
 
402 aa  705  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  822  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  55.83 
 
 
403 aa  460  1e-128  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  40.45 
 
 
394 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  36.79 
 
 
389 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  35.28 
 
 
384 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 
389 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  35.31 
 
 
391 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  34.41 
 
 
390 aa  185  1e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 
382 aa  184  2e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  35.7 
 
 
389 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  33.42 
 
 
388 aa  183  4e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  35.12 
 
 
388 aa  183  5e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  34.09 
 
 
389 aa  183  5e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  34.6 
 
 
385 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  34.48 
 
 
391 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 
382 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  35.57 
 
 
385 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  34.9 
 
 
390 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  2.99159e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  35.21 
 
 
387 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  32.11 
 
 
380 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  34.4 
 
 
382 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  35.06 
 
 
382 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  33.91 
 
 
388 aa  176  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  34.51 
 
 
383 aa  175  1e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  36.61 
 
 
385 aa  174  2e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  33.67 
 
 
390 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
388 aa  172  7e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  33.58 
 
 
402 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.93 
 
 
381 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  33.8 
 
 
403 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  33.58 
 
 
402 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.29 
 
 
390 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.6 
 
 
385 aa  166  9e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.43 
 
 
380 aa  164  2e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33 
 
 
383 aa  163  4e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33.08 
 
 
393 aa  164  4e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.16 
 
 
385 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  34.07 
 
 
390 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.98 
 
 
390 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  32.17 
 
 
383 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.13364e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  33.06 
 
 
394 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  34.77 
 
 
390 aa  159  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  34 
 
 
383 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.81 
 
 
389 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  31.59 
 
 
384 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.86 
 
 
387 aa  156  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  34.93 
 
 
391 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  31.99 
 
 
383 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.94 
 
 
381 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  30.41 
 
 
381 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  31.03 
 
 
379 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  30.63 
 
 
383 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.32 
 
 
388 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  32.57 
 
 
388 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  35.16 
 
 
388 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  33.52 
 
 
390 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 
395 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.03 
 
 
378 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.69 
 
 
380 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  29.6 
 
 
379 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 
382 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  31.47 
 
 
378 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.09 
 
 
383 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  29.9 
 
 
379 aa  142  1e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  31.04 
 
 
389 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  33 
 
 
382 aa  140  4e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  29.35 
 
 
379 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  31.3 
 
 
394 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  31.56 
 
 
388 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  31.56 
 
 
388 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  31.56 
 
 
388 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  32.6 
 
 
389 aa  135  1e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  30.21 
 
 
390 aa  132  8e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  29.67 
 
 
385 aa  132  1e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  31.13 
 
 
404 aa  132  1e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.62 
 
 
385 aa  132  2e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1833  putative thiolase  30.73 
 
 
405 aa  130  4e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0913085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.57 
 
 
388 aa  130  5e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  29.23 
 
 
379 aa  129  8e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  31.47 
 
 
383 aa  128  2e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  32.69 
 
 
390 aa  128  2e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  31.65 
 
 
383 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  33.33 
 
 
384 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.4 
 
 
390 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.97 
 
 
388 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.97 
 
 
388 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  28.47 
 
 
406 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  32.81 
 
 
389 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.76 
 
 
384 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  29.14 
 
 
396 aa  122  1e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  30.73 
 
 
393 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  29.81 
 
 
394 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  29.52 
 
 
391 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  29.28 
 
 
395 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  31.98 
 
 
378 aa  119  1e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  30.26 
 
 
386 aa  118  2e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  7.7821e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>