102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0037 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0027  hypothetical protein  97.91 
 
 
623 aa  1076  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.476694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0046  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1232  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0037  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1232  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  44.87 
 
 
1184 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  43.66 
 
 
1224 aa  358  2e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  42.6 
 
 
1209 aa  346  8e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  43.69 
 
 
1263 aa  340  3e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  43.69 
 
 
1168 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  43.69 
 
 
1184 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  34.27 
 
 
1219 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  32.18 
 
 
1219 aa  199  1e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  29.92 
 
 
502 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  28.79 
 
 
509 aa  156  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  28.04 
 
 
1217 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
556 aa  78.6  3e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  31.22 
 
 
544 aa  78.6  3e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  34.44 
 
 
535 aa  76.6  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  5.66508e-07 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  30.04 
 
 
477 aa  73.2  1e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 
498 aa  69.7  2e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.51 
 
 
533 aa  67  1e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  29.73 
 
 
503 aa  61.2  5e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 
468 aa  60.1  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
522 aa  59.7  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.17 
 
 
728 aa  56.2  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 
1652 aa  55.5  3e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2140  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
532 aa  55.5  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 
545 aa  55.1  3e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
562 aa  54.7  5e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 
525 aa  54.3  6e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31870  hypothetical protein  27.87 
 
 
872 aa  53.5  1e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.66 
 
 
546 aa  53.1  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
622 aa  52.8  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  31.02 
 
 
532 aa  52  3e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2145  hypothetical protein  28.97 
 
 
473 aa  52.4  3e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
468 aa  51.6  5e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 
468 aa  50.8  6e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3155  hypothetical protein  29.23 
 
 
329 aa  51.2  6e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.48 
 
 
406 aa  51.2  6e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 
695 aa  50.8  7e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  29.55 
 
 
505 aa  50.8  8e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  28.86 
 
 
403 aa  50.4  8e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
398 aa  50.8  8e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 
691 aa  50.4  8e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
730 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
679 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.91 
 
 
740 aa  50.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.98 
 
 
692 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.32 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.28 
 
 
696 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.29 
 
 
499 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  28.79 
 
 
443 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
419 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 
443 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  25.36 
 
 
593 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 
443 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  31.37 
 
 
621 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
638 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  1.82668e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3367  hypothetical protein  29.27 
 
 
690 aa  48.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  22.22 
 
 
621 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.1 
 
 
700 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  21.36 
 
 
662 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95129e-07 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  28.03 
 
 
436 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
517 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.76 
 
 
613 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  28.03 
 
 
430 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 
703 aa  47.8  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
450 aa  47.4  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  27.04 
 
 
477 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  29.49 
 
 
736 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 
398 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 
528 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 
398 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
595 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
528 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0667  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
636 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.19 
 
 
579 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  29.56 
 
 
675 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.4 
 
 
591 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  31.61 
 
 
661 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
691 aa  45.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  30 
 
 
596 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  22.92 
 
 
625 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  24.22 
 
 
561 aa  45.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 
631 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
487 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1541  hypothetical protein  30.46 
 
 
443 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907452  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
705 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
581 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.81 
 
 
518 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
615 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
507 aa  44.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  22.12 
 
 
612 aa  44.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 
557 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7418  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
543 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125442  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 
525 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
659 aa  44.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 
368 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  28.03 
 
 
431 aa  44.3  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
513 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2236  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.08 
 
 
535 aa  43.9  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>