289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0026 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0026  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
222 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0034  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
222 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0370296 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5490  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.63 
 
 
155 aa  162  5e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.098913 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5890  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.63 
 
 
155 aa  162  5e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.77 
 
 
243 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.18 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
219 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.61 
 
 
300 aa  84.3  1e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.71 
 
 
231 aa  83.6  2e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.1 
 
 
217 aa  84  2e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
194 aa  83.2  3e-15  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.57 
 
 
193 aa  82.8  4e-15  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  6.29945e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.57 
 
 
193 aa  82.8  4e-15  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.23475e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.73 
 
 
223 aa  81.6  8e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0091  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35 
 
 
216 aa  81.3  1e-14  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.48 
 
 
209 aa  81.3  1e-14  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30 
 
 
273 aa  80.9  1e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.78 
 
 
294 aa  81.3  1e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.5 
 
 
223 aa  80.1  2e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  30.4 
 
 
213 aa  80.1  2e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.8 
 
 
304 aa  80.1  2e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.5 
 
 
223 aa  80.1  2e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.18 
 
 
219 aa  80.5  2e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  79.7  3e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.59 
 
 
202 aa  79.7  3e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  28.72 
 
 
200 aa  80.1  3e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.57 
 
 
196 aa  80.1  3e-14  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.82 
 
 
264 aa  80.1  3e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1195  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.82 
 
 
258 aa  79.3  4e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.44 
 
 
341 aa  78.6  6e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  36.22 
 
 
455 aa  78.6  8e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  36.22 
 
 
455 aa  78.2  8e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  36.22 
 
 
455 aa  78.6  8e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  36.22 
 
 
455 aa  78.6  8e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  36.22 
 
 
468 aa  78.2  8e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  36.22 
 
 
220 aa  78.2  9e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.3 
 
 
241 aa  78.2  1e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  36.22 
 
 
455 aa  78.2  1e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  36.22 
 
 
433 aa  76.6  2e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.06 
 
 
200 aa  77  2e-13  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.31 
 
 
249 aa  77  2e-13  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.9 
 
 
211 aa  77  2e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.72 
 
 
190 aa  76.6  3e-13  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
204 aa  76.6  3e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.65 
 
 
200 aa  75.9  4e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.86 
 
 
358 aa  76.3  4e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.48 
 
 
220 aa  75.5  6e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.85 
 
 
210 aa  75.1  7e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.88 
 
 
254 aa  75.1  7e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.25 
 
 
191 aa  75.1  8e-13  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.32 
 
 
245 aa  75.1  8e-13  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.13 
 
 
211 aa  74.7  9e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.81 
 
 
192 aa  74.7  1e-12  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.45 
 
 
367 aa  73.9  2e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.45 
 
 
345 aa  73.6  2e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.52 
 
 
264 aa  73.6  2e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.35 
 
 
205 aa  73.6  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.98 
 
 
209 aa  73.2  3e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.43 
 
 
245 aa  73.2  3e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.92 
 
 
184 aa  72.8  4e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.56 
 
 
264 aa  72.8  4e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.86 
 
 
309 aa  72.4  5e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.43 
 
 
295 aa  72.4  5e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  32.2 
 
 
292 aa  72  6e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.43 
 
 
205 aa  72.4  6e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.82 
 
 
264 aa  72.4  6e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.66 
 
 
187 aa  72  7e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  8.74061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.8 
 
 
330 aa  72  7e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.65 
 
 
342 aa  72  7e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.65 
 
 
346 aa  72  7e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.65 
 
 
346 aa  72  7e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.65 
 
 
336 aa  71.6  9e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.65 
 
 
210 aa  71.6  9e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.69 
 
 
209 aa  70.9  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.86 
 
 
201 aa  70.9  1e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.83 
 
 
217 aa  71.2  1e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.81 
 
 
189 aa  71.2  1e-11  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.45 
 
 
193 aa  70.5  2e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4616  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.14 
 
 
334 aa  70.9  2e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.14 
 
 
323 aa  70.5  2e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.15 
 
 
264 aa  70.5  2e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.77 
 
 
190 aa  69.7  3e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2334  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.3 
 
 
219 aa  70.1  3e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.65 
 
 
194 aa  69.7  3e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  29.82 
 
 
206 aa  69.7  4e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.75 
 
 
294 aa  69.3  4e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.6016e-05 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.4 
 
 
271 aa  69.3  4e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2161  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.64 
 
 
191 aa  69.3  4e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.336529  hitchhiker  0.000279236 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.6 
 
 
217 aa  69.3  4e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.08 
 
 
205 aa  69.3  4e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  4.09376e-06 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.09 
 
 
317 aa  69.3  5e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  33.07 
 
 
260 aa  69.3  5e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.35 
 
 
235 aa  68.9  6e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  33.05 
 
 
213 aa  68.6  7e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.67 
 
 
401 aa  68.6  7e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.28 
 
 
253 aa  68.6  8e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.5 
 
 
414 aa  68.2  9e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  30.25 
 
 
210 aa  67.8  1e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.53711e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.66 
 
 
186 aa  68.2  1e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.59527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32 
 
 
189 aa  67.8  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>