More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0017 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  84.73 
 
 
491 aa  847    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
491 aa  989    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
491 aa  989    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  79.3 
 
 
491 aa  770    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
491 aa  989    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  83.5 
 
 
491 aa  836    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  58.08 
 
 
504 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  54.62 
 
 
495 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  54.55 
 
 
489 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.61 
 
 
493 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  51.23 
 
 
482 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.2 
 
 
488 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  50.3 
 
 
485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  50.61 
 
 
480 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.85 
 
 
480 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.23 
 
 
485 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  46.89 
 
 
489 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.44 
 
 
489 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  45.55 
 
 
485 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.23 
 
 
485 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.9 
 
 
483 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.73 
 
 
483 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  42.29 
 
 
503 aa  362  9e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  42.06 
 
 
501 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  44 
 
 
493 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.7 
 
 
481 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  41.01 
 
 
490 aa  342  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.7 
 
 
487 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  43.5 
 
 
490 aa  333  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.12 
 
 
484 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  38.65 
 
 
488 aa  309  6.999999999999999e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  39.35 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.63 
 
 
486 aa  299  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  36.73 
 
 
488 aa  298  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 
486 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  36.4 
 
 
492 aa  286  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.01 
 
 
490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.02 
 
 
481 aa  280  4e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  38.46 
 
 
504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
473 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  38.32 
 
 
493 aa  249  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  33.99 
 
 
489 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 
458 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  30.97 
 
 
972 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  30.43 
 
 
471 aa  223  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 
478 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 
461 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.98 
 
 
470 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.46 
 
 
476 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
503 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
578 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 
577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  33.47 
 
 
933 aa  196  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  31.6 
 
 
487 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.4 
 
 
487 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 
924 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 
570 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 
573 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.25 
 
 
640 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
954 aa  176  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  31.26 
 
 
921 aa  176  7e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.57 
 
 
574 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 
584 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  30.89 
 
 
579 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 
611 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
636 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 
645 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 
629 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
629 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.62 
 
 
610 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  32.42 
 
 
631 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 
635 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 
642 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 
629 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 
631 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
643 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.36 
 
 
646 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  31.09 
 
 
557 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 
681 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  30.75 
 
 
635 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.7 
 
 
629 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 
600 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.47 
 
 
646 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.68 
 
 
639 aa  153  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 
557 aa  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 
647 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.93 
 
 
646 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 
630 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 
535 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  31.83 
 
 
617 aa  150  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.33 
 
 
630 aa  150  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
634 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 
630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  29.82 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 
631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 
649 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 
723 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>