97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0013 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  99.64 
 
 
278 aa  553  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  83.74 
 
 
272 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  80.41 
 
 
253 aa  406  1e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  74.29 
 
 
262 aa  335  5e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  48.37 
 
 
242 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  44.96 
 
 
255 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  42.15 
 
 
263 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  43.39 
 
 
270 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  43.04 
 
 
249 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  44.34 
 
 
234 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  43.32 
 
 
309 aa  163  2e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  39.17 
 
 
250 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  42.4 
 
 
267 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  43.58 
 
 
252 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  47.78 
 
 
329 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  52.21 
 
 
296 aa  140  2e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  51.88 
 
 
243 aa  138  8e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  41.15 
 
 
257 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  38.53 
 
 
280 aa  132  7e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  46.92 
 
 
251 aa  128  9e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  46.43 
 
 
253 aa  128  1e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  32.96 
 
 
273 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  31.4 
 
 
245 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  36.36 
 
 
266 aa  120  2e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  32.64 
 
 
240 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  26.32 
 
 
247 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  35.37 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  27.57 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  29.47 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  32.66 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  32.08 
 
 
243 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  30 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  32.32 
 
 
215 aa  84  3e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  29.51 
 
 
234 aa  82.8  5e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  30.59 
 
 
234 aa  83.2  5e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  26.83 
 
 
238 aa  81.6  1e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  38.41 
 
 
290 aa  82  1e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  33.76 
 
 
273 aa  80.5  2e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  36.24 
 
 
292 aa  80.9  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  29.91 
 
 
306 aa  81.3  2e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  28.43 
 
 
236 aa  79  9e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  35.52 
 
 
301 aa  79  9e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  29.65 
 
 
233 aa  77.8  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  25.12 
 
 
235 aa  75.9  7e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.89323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  29.5 
 
 
316 aa  75.5  8e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  27.72 
 
 
234 aa  74.3  2e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  36.97 
 
 
237 aa  73.9  3e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  31.07 
 
 
307 aa  72.8  6e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  29.72 
 
 
315 aa  72.4  8e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  28.5 
 
 
309 aa  71.2  2e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  32.11 
 
 
234 aa  70.5  3e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  40.4 
 
 
290 aa  70.1  4e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  31.38 
 
 
288 aa  69.7  5e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  31.16 
 
 
286 aa  68.9  9e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  29.85 
 
 
286 aa  67.4  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  29.9 
 
 
236 aa  68.2  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  25.51 
 
 
230 aa  65.1  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  29.61 
 
 
299 aa  64.7  2e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  30.48 
 
 
246 aa  63.5  3e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  29.02 
 
 
383 aa  63.9  3e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  30.85 
 
 
230 aa  63.2  4e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  25.97 
 
 
331 aa  63.5  4e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  22.7 
 
 
243 aa  63.2  5e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  33.01 
 
 
243 aa  62.4  9e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  24.58 
 
 
233 aa  60.8  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  28.08 
 
 
234 aa  59.7  6e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  28.99 
 
 
297 aa  57.4  2e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  34 
 
 
349 aa  55.5  1e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  24.3 
 
 
325 aa  55.1  1e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  25.91 
 
 
304 aa  54.3  2e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  25.91 
 
 
304 aa  54.3  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  25.91 
 
 
304 aa  54.3  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  25.4 
 
 
292 aa  53.9  3e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  31.48 
 
 
296 aa  53.1  5e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  21.56 
 
 
278 aa  52  1e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  31.36 
 
 
258 aa  51.6  1e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  35.48 
 
 
297 aa  52  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 
255 aa  50.1  4e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  23 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  27.91 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  25.4 
 
 
436 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  33.71 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  31.58 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  28.57 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  29.63 
 
 
296 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  34 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  26.04 
 
 
250 aa  45.4  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  26.47 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  27.87 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  28.21 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  24.4 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  24.4 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  24.4 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  25.52 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1025  protein of unknown function DUF881  26.04 
 
 
239 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.40335e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>