More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0010 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
175 aa  357  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
175 aa  357  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
175 aa  357  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  90.29 
 
 
187 aa  327  5e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  89.14 
 
 
181 aa  325  2e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  89.6 
 
 
182 aa  298  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  81.18 
 
 
173 aa  260  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  79.52 
 
 
178 aa  250  9e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  77.84 
 
 
182 aa  248  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  74.43 
 
 
177 aa  240  9e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  65.9 
 
 
176 aa  223  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  71.18 
 
 
182 aa  222  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  70.66 
 
 
170 aa  216  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  63.01 
 
 
178 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
177 aa  213  1e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  70.48 
 
 
176 aa  211  6e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  61.36 
 
 
179 aa  210  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  62.65 
 
 
175 aa  208  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  69.88 
 
 
176 aa  208  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.57 
 
 
179 aa  208  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  70.91 
 
 
170 aa  207  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  67.06 
 
 
177 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  62.05 
 
 
174 aa  206  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  62.13 
 
 
173 aa  206  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  58.29 
 
 
174 aa  205  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  63.47 
 
 
206 aa  204  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
175 aa  203  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  58.14 
 
 
172 aa  202  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  57.87 
 
 
181 aa  199  1e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.77678e-13 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  65.66 
 
 
182 aa  199  1e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  58.05 
 
 
176 aa  198  4e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  57.3 
 
 
181 aa  197  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  56.98 
 
 
172 aa  196  2e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.8 
 
 
184 aa  191  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  62.5 
 
 
179 aa  190  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  55.43 
 
 
178 aa  189  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.5 
 
 
172 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  56.9 
 
 
193 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  59.66 
 
 
179 aa  182  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  54.82 
 
 
188 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.28 
 
 
201 aa  177  6e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  54.82 
 
 
188 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  59.04 
 
 
180 aa  172  2e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  61.82 
 
 
228 aa  171  4e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  51.81 
 
 
287 aa  168  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  58.33 
 
 
176 aa  167  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  52.1 
 
 
176 aa  164  6e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.73 
 
 
376 aa  164  7e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.07 
 
 
189 aa  163  1e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  60.14 
 
 
310 aa  163  1e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
266 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  49.41 
 
 
571 aa  158  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  49.4 
 
 
241 aa  158  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  57.64 
 
 
310 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.12 
 
 
378 aa  152  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  52.57 
 
 
179 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  47.02 
 
 
657 aa  147  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  52.47 
 
 
357 aa  147  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.44 
 
 
196 aa  147  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  54.82 
 
 
168 aa  147  1e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  56.03 
 
 
372 aa  145  2e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  62.12 
 
 
168 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.28 
 
 
468 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.17 
 
 
310 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  61.36 
 
 
168 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  46.11 
 
 
174 aa  143  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  61.36 
 
 
168 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  48.82 
 
 
172 aa  140  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  45.29 
 
 
160 aa  139  2e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  45.35 
 
 
665 aa  139  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
254 aa  138  5e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.98862e-05 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  49.68 
 
 
254 aa  134  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  58.74 
 
 
322 aa  134  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  52.27 
 
 
376 aa  134  6e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.76 
 
 
629 aa  134  6e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  46.15 
 
 
178 aa  133  1e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.61 
 
 
466 aa  131  4e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
222 aa  132  4e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  44.07 
 
 
533 aa  131  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  54.17 
 
 
164 aa  131  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  46.55 
 
 
573 aa  129  1e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  46.47 
 
 
629 aa  130  1e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  51.45 
 
 
161 aa  129  2e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  48.52 
 
 
197 aa  129  2e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  46.67 
 
 
155 aa  128  4e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  53.47 
 
 
164 aa  128  5e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  46.06 
 
 
219 aa  127  8e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  49.01 
 
 
181 aa  126  1e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1025  peptidylprolyl isomerase  43.89 
 
 
209 aa  126  2e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.66369e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.13 
 
 
195 aa  125  2e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  47.19 
 
 
181 aa  125  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.89 
 
 
202 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
164 aa  125  4e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.94 
 
 
218 aa  125  4e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  54.93 
 
 
167 aa  124  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  44.24 
 
 
184 aa  124  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  43.68 
 
 
156 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.31 
 
 
197 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.17427e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  44.67 
 
 
247 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.57501e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.1 
 
 
197 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>