More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0007 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  65.48 
 
 
839 aa  931  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  46.67 
 
 
807 aa  638  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 
823 aa  640  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00110  DNA gyrase subunit A  58.5 
 
 
943 aa  822  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  49.93 
 
 
870 aa  674  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0007  DNA gyrase subunit A  63.31 
 
 
902 aa  889  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  46.91 
 
 
836 aa  637  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  61.71 
 
 
875 aa  870  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  69.26 
 
 
834 aa  971  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  73.88 
 
 
841 aa  1073  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  46.24 
 
 
899 aa  640  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0006  DNA gyrase subunit A  60.78 
 
 
871 aa  844  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.307841 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  48.63 
 
 
901 aa  657  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  47.67 
 
 
830 aa  659  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  82.81 
 
 
827 aa  1163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0007  DNA gyrase subunit A  100 
 
 
1257 aa  2561  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  47.4 
 
 
852 aa  636  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  75.75 
 
 
831 aa  1058  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  46.99 
 
 
839 aa  644  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  46.99 
 
 
839 aa  644  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  47.39 
 
 
827 aa  640  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  48.43 
 
 
820 aa  659  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  47.6 
 
 
932 aa  638  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0007  DNA gyrase subunit A  59.18 
 
 
922 aa  848  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0007  DNA gyrase subunit A  66.95 
 
 
875 aa  943  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876673  normal  0.542792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0821  DNA gyrase, A subunit  87.42 
 
 
1261 aa  2241  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308334  normal  0.183693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  72.49 
 
 
839 aa  1018  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  49.93 
 
 
811 aa  657  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  47.46 
 
 
823 aa  639  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0007  DNA gyrase subunit A  63.58 
 
 
876 aa  884  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.1369e-13 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  90.31 
 
 
838 aa  1275  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0007  DNA gyrase subunit A  62.77 
 
 
910 aa  868  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  47.9 
 
 
821 aa  649  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 
823 aa  636  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 
823 aa  644  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  48.62 
 
 
818 aa  667  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.9295e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0007  DNA gyrase subunit A  63.36 
 
 
885 aa  879  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.743623  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0015  DNA gyrase subunit A  100 
 
 
1257 aa  2561  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336793  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  76.27 
 
 
840 aa  1075  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0007  DNA gyrase, A subunit  88.46 
 
 
1262 aa  2291  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.641743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  47.05 
 
 
827 aa  645  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  72.35 
 
 
839 aa  1015  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16309e-06 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00060  DNA gyrase subunit A  59.39 
 
 
898 aa  822  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  67.72 
 
 
837 aa  949  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  48.92 
 
 
827 aa  658  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  49.05 
 
 
825 aa  652  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  100 
 
 
836 aa  1411  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 
823 aa  641  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  62.07 
 
 
883 aa  870  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  48.11 
 
 
814 aa  639  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.66151e-07  unclonable  1.53333e-08 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  66.38 
 
 
870 aa  923  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  64.79 
 
 
834 aa  927  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  65.34 
 
 
848 aa  929  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  71.97 
 
 
822 aa  974  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  84.38 
 
 
837 aa  1206  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 
823 aa  637  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.47 
 
 
836 aa  949  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  49.49 
 
 
883 aa  637  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 
823 aa  637  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  59.15 
 
 
883 aa  840  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 
823 aa  637  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0007  DNA gyrase, A subunit  62.46 
 
 
870 aa  869  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 
823 aa  637  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  66.95 
 
 
834 aa  956  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  48.55 
 
 
809 aa  641  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  47.32 
 
 
828 aa  642  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  9.29696e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  60.17 
 
 
876 aa  858  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 
823 aa  640  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0007  DNA gyrase, A subunit  63.07 
 
 
856 aa  850  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  70.63 
 
 
831 aa  999  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  46.76 
 
 
836 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  48.76 
 
 
818 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  46.71 
 
 
828 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  47.17 
 
 
949 aa  627  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  44.89 
 
 
815 aa  624  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  46.67 
 
 
857 aa  625  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  45.35 
 
 
807 aa  625  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  45.57 
 
 
828 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  5.07659e-05  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  46.2 
 
 
826 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  46.69 
 
 
815 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  46.9 
 
 
840 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  45.1 
 
 
864 aa  619  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  45.85 
 
 
838 aa  617  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  45.75 
 
 
893 aa  618  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  46.38 
 
 
824 aa  616  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  44.01 
 
 
829 aa  617  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  46.38 
 
 
809 aa  615  1e-174  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  46.19 
 
 
857 aa  615  1e-174  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.93628e-06  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  47.81 
 
 
823 aa  614  1e-174  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  44.01 
 
 
864 aa  613  1e-174  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  45.75 
 
 
889 aa  615  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  46.37 
 
 
816 aa  615  1e-174  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  46.11 
 
 
832 aa  614  1e-174  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  45.75 
 
 
889 aa  615  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  45.57 
 
 
848 aa  611  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  44.08 
 
 
828 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  46.16 
 
 
802 aa  612  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 
849 aa  611  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  45.74 
 
 
830 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.24756e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  44.55 
 
 
893 aa  612  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>