More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0007 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 		 823 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  48.63 
 
 		 901 aa  657    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  64.79 
 
 		 834 aa  927    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0006  DNA gyrase subunit A  60.78 
 
 		 871 aa  844    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.307841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0821  DNA gyrase, A subunit  87.42 
 
 		 1261 aa  2241    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308334  normal  0.183693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0007  DNA gyrase, A subunit  63.07 
 
 		 856 aa  850    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 		 823 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  72.49 
 
 		 839 aa  1018    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  84.38 
 
 		 837 aa  1206    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  47.9 
 
 		 821 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 		 823 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 		 823 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 		 823 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  47.32 
 
 		 828 aa  642    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  76.27 
 
 		 840 aa  1075    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  49.93 
 
 		 811 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  65.34 
 
 		 848 aa  929    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  65.48 
 
 		 839 aa  931    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  75.75 
 
 		 831 aa  1058    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  72.35 
 
 		 839 aa  1015    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  61.71 
 
 		 875 aa  870    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  62.07 
 
 		 883 aa  870    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  48.92 
 
 		 827 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  66.38 
 
 		 870 aa  923    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 		 823 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  90.31 
 
 		 838 aa  1275    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  48.11 
 
 		 814 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0007  DNA gyrase subunit A  62.77 
 
 		 910 aa  868    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  66.95 
 
 		 834 aa  956    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  71.97 
 
 		 822 aa  974    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 		 823 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  49.93 
 
 		 870 aa  674    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  47.31 
 
 		 823 aa  636    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  47.67 
 
 		 830 aa  659    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  48.62 
 
 		 818 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  48.43 
 
 		 820 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00110  DNA gyrase subunit A  58.5 
 
 		 943 aa  822    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  46.91 
 
 		 836 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0007  DNA gyrase subunit A  100 
 
 		 1257 aa  2561    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  47.4 
 
 		 852 aa  636    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  47.61 
 
 		 823 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  82.81 
 
 		 827 aa  1163    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0007  DNA gyrase, A subunit  62.46 
 
 		 870 aa  869    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  46.99 
 
 		 839 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  46.99 
 
 		 839 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0007  DNA gyrase subunit A  63.58 
 
 		 876 aa  884    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000011369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  49.49 
 
 		 883 aa  637    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  67.72 
 
 		 837 aa  949    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  47.46 
 
 		 823 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  73.88 
 
 		 841 aa  1073    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  70.63 
 
 		 831 aa  999    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  49.05 
 
 		 825 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  47.6 
 
 		 932 aa  638    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0007  DNA gyrase subunit A  63.36 
 
 		 885 aa  879    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.743623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  46.67 
 
 		 807 aa  638    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0007  DNA gyrase subunit A  66.95 
 
 		 875 aa  943    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876673  normal  0.542792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0007  DNA gyrase subunit A  63.31 
 
 		 902 aa  889    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00060  DNA gyrase subunit A  59.39 
 
 		 898 aa  822    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  48.55 
 
 		 809 aa  641    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  47.05 
 
 		 827 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  69.26 
 
 		 834 aa  971    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  60.17 
 
 		 876 aa  858    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.47 
 
 		 836 aa  949    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  47.39 
 
 		 827 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0007  DNA gyrase subunit A  59.18 
 
 		 922 aa  848    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  46.24 
 
 		 899 aa  640    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0015  DNA gyrase subunit A  100 
 
 		 1257 aa  2561    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336793  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  100 
 
 		 836 aa  1411    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0007  DNA gyrase, A subunit  88.46 
 
 		 1262 aa  2291    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641743 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  59.15 
 
 		 883 aa  840    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  46.76 
 
 		 836 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  48.76 
 
 		 818 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  47.17 
 
 		 949 aa  627  1e-178  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  46.71 
 
 		 828 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  46.67 
 
 		 857 aa  625  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  44.89 
 
 		 815 aa  624  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  45.35 
 
 		 807 aa  625  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  45.57 
 
 		 828 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  46.2 
 
 		 826 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  46.9 
 
 		 840 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  46.69 
 
 		 815 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  45.75 
 
 		 893 aa  618  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  45.85 
 
 		 838 aa  617  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  45.1 
 
 		 864 aa  619  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  46.38 
 
 		 824 aa  616  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  44.01 
 
 		 829 aa  617  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00070  DNA gyrase, A subunit  46.37 
 
 		 816 aa  615  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  46.19 
 
 		 857 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  44.01 
 
 		 864 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  45.75 
 
 		 889 aa  615  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  46.38 
 
 		 809 aa  615  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  47.81 
 
 		 823 aa  614  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  45.75 
 
 		 889 aa  615  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  46.11 
 
 		 832 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  44.08 
 
 		 828 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 		 849 aa  611  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  45.74 
 
 		 830 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0027  DNA gyrase, A subunit  45.57 
 
 		 848 aa  611  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  46.16 
 
 		 802 aa  612  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  45.71 
 
 		 813 aa  612  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>