More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0006 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  65.62 
 
 
649 aa  859  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  65.34 
 
 
719 aa  857  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.26 
 
 
647 aa  672  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  52 
 
 
641 aa  662  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  63.34 
 
 
686 aa  873  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  50.22 
 
 
646 aa  647  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  52.1 
 
 
642 aa  654  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00100  DNA gyrase subunit B  63.02 
 
 
711 aa  788  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.89 
 
 
633 aa  673  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  53.61 
 
 
640 aa  651  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  51.62 
 
 
645 aa  685  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  60.63 
 
 
701 aa  795  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  52.43 
 
 
648 aa  687  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  87.11 
 
 
714 aa  1188  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  53.61 
 
 
640 aa  651  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  60.53 
 
 
686 aa  768  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  52.3 
 
 
640 aa  673  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  71.75 
 
 
654 aa  973  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  52.51 
 
 
648 aa  689  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.66462e-07  hitchhiker  9.32752e-07 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  94.52 
 
 
675 aa  1273  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  53.48 
 
 
650 aa  676  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  62.1 
 
 
696 aa  838  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.5 
 
 
628 aa  726  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  52.21 
 
 
649 aa  709  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  65.04 
 
 
666 aa  848  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  50.07 
 
 
643 aa  639  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  79.43 
 
 
685 aa  1085  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  61.01 
 
 
711 aa  765  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
675 aa  1386  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  96.74 
 
 
675 aa  1275  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 
640 aa  687  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  57.69 
 
 
696 aa  780  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  72.02 
 
 
670 aa  932  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  53.67 
 
 
635 aa  650  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
675 aa  1386  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  53.52 
 
 
637 aa  646  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  53.62 
 
 
638 aa  667  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  52.54 
 
 
637 aa  681  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  64.42 
 
 
661 aa  868  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  50.9 
 
 
647 aa  644  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  53.15 
 
 
640 aa  715  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  47.94 
 
 
665 aa  643  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
643 aa  640  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  50.9 
 
 
651 aa  650  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.66 
 
 
644 aa  660  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  51.34 
 
 
636 aa  664  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  50.15 
 
 
644 aa  654  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  54.69 
 
 
644 aa  702  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  50.07 
 
 
654 aa  639  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.15 
 
 
640 aa  673  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.74 
 
 
640 aa  677  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  49.93 
 
 
654 aa  636  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  9.67673e-06  decreased coverage  6.94445e-13 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  48.47 
 
 
650 aa  648  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.15 
 
 
640 aa  673  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  50.07 
 
 
654 aa  638  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.39989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  52.06 
 
 
635 aa  660  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  49.93 
 
 
654 aa  638  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  61.84 
 
 
695 aa  840  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.1906e-14 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  50.97 
 
 
642 aa  667  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  71.64 
 
 
657 aa  976  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  51.25 
 
 
652 aa  647  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  49.63 
 
 
653 aa  635  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  61.4 
 
 
720 aa  827  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  67.76 
 
 
652 aa  846  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  55.92 
 
 
640 aa  697  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  66.08 
 
 
648 aa  871  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47413e-07 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  63.28 
 
 
685 aa  816  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  52.84 
 
 
642 aa  652  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  51.35 
 
 
650 aa  674  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.73734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  52.68 
 
 
645 aa  652  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  52.44 
 
 
640 aa  672  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  56.07 
 
 
633 aa  717  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  50.52 
 
 
635 aa  646  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  51.71 
 
 
637 aa  693  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  53.05 
 
 
642 aa  662  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  50.89 
 
 
636 aa  636  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.44 
 
 
640 aa  676  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  52.53 
 
 
641 aa  677  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  53.63 
 
 
636 aa  644  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0010  DNA gyrase, B subunit  68.31 
 
 
680 aa  881  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.15 
 
 
640 aa  673  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  50.07 
 
 
654 aa  639  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  51.71 
 
 
644 aa  665  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  53.29 
 
 
632 aa  702  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  50.36 
 
 
675 aa  689  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  56.8 
 
 
691 aa  771  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.15 
 
 
640 aa  673  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  67.41 
 
 
647 aa  877  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  51.5 
 
 
642 aa  645  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  100 
 
 
675 aa  1386  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  66.77 
 
 
647 aa  872  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  66.72 
 
 
679 aa  832  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  50.07 
 
 
654 aa  639  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.3182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  50.67 
 
 
643 aa  656  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0006  DNA gyrase, B subunit  62.74 
 
 
698 aa  793  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  51.55 
 
 
637 aa  686  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  52.69 
 
 
633 aa  679  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  50.07 
 
 
654 aa  639  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.34084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  65.74 
 
 
656 aa  884  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  75.7 
 
 
688 aa  1023  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>