59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0005 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  77.49 
 
 
185 aa  279  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  71.88 
 
 
188 aa  259  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  72.46 
 
 
187 aa  225  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  60.89 
 
 
180 aa  182  2e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  63.54 
 
 
184 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  67.44 
 
 
217 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  53.68 
 
 
166 aa  141  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  60 
 
 
143 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  50 
 
 
188 aa  133  2e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  52.14 
 
 
185 aa  127  9e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  50.72 
 
 
217 aa  126  2e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  45.51 
 
 
185 aa  126  2e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.33 
 
 
196 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  55.97 
 
 
198 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  49.18 
 
 
273 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  55.74 
 
 
201 aa  117  1e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.12 
 
 
196 aa  116  2e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  49.11 
 
 
134 aa  116  2e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  46.22 
 
 
173 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  49.23 
 
 
187 aa  114  9e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  43.38 
 
 
188 aa  113  2e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  43.79 
 
 
266 aa  113  2e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  45.6 
 
 
177 aa  112  4e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  43.55 
 
 
207 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  43.07 
 
 
172 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  42.24 
 
 
164 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  45 
 
 
171 aa  102  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  43.7 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  34.97 
 
 
179 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  42.5 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  46.67 
 
 
171 aa  91.3  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  44.68 
 
 
173 aa  89  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  33.96 
 
 
155 aa  75.9  3e-13  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  38.3 
 
 
117 aa  73.2  2e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  34.21 
 
 
156 aa  67.8  9e-11  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  36.99 
 
 
151 aa  63.2  3e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  36.99 
 
 
153 aa  62.4  4e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  37.68 
 
 
152 aa  57.4  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  27.5 
 
 
160 aa  55.5  5e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  29.41 
 
 
159 aa  53.9  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  32.89 
 
 
168 aa  50.8  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  28.74 
 
 
300 aa  48.9  4e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  33.73 
 
 
162 aa  48.5  6e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  1.88483e-05 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  30.77 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0967  hypothetical protein  26.97 
 
 
92 aa  45.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  34.74 
 
 
105 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  27.85 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  29.41 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  26.44 
 
 
286 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0709  hypothetical protein  25.51 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0706  hypothetical protein  25.51 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  34.43 
 
 
86 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.77054e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0713  hypothetical protein  25.51 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  26.19 
 
 
97 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  23.08 
 
 
97 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>