More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3757 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  100 
 
 		 556 aa  1139    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  39.29 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.91 
 
 		 595 aa  346  7e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.62 
 
 		 567 aa  346  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  39.73 
 
 		 545 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  37.12 
 
 		 536 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.05 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.39 
 
 		 614 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  40.92 
 
 		 552 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  38.24 
 
 		 528 aa  339  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  37.79 
 
 		 550 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.71 
 
 		 560 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.06 
 
 		 560 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  44.03 
 
 		 536 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.52 
 
 		 578 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  37.57 
 
 		 531 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.29 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  35.33 
 
 		 547 aa  329  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 		 560 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  38 
 
 		 552 aa  329  8e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 		 560 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.74 
 
 		 557 aa  329  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.26 
 
 		 578 aa  329  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  39.21 
 
 		 545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  42.86 
 
 		 539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  34.24 
 
 		 592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  34.18 
 
 		 605 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  35.05 
 
 		 609 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  36.76 
 
 		 542 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  35.31 
 
 		 556 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  33.95 
 
 		 589 aa  325  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  39.05 
 
 		 542 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.64 
 
 		 575 aa  324  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  36.65 
 
 		 530 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  39.53 
 
 		 537 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  36.19 
 
 		 570 aa  323  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.22 
 
 		 609 aa  323  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  35.13 
 
 		 556 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  36.72 
 
 		 545 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  32.88 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.6 
 
 		 632 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  32.77 
 
 		 616 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.91 
 
 		 554 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.91 
 
 		 554 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.04 
 
 		 552 aa  321  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.51 
 
 		 553 aa  320  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.15 
 
 		 550 aa  320  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.5 
 
 		 552 aa  320  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.5 
 
 		 552 aa  320  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.71 
 
 		 555 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.5 
 
 		 553 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  34.06 
 
 		 600 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  36.98 
 
 		 566 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.85 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.66 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.66 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  35.42 
 
 		 557 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  34.16 
 
 		 551 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.42 
 
 		 552 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.57 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  35.77 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.2 
 
 		 558 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.2 
 
 		 558 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.2 
 
 		 558 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  36.91 
 
 		 541 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.2 
 
 		 558 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.2 
 
 		 558 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.2 
 
 		 558 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.2 
 
 		 558 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  36.91 
 
 		 541 aa  317  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.58 
 
 		 629 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.31 
 
 		 620 aa  316  7e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.29 
 
 		 553 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  36.03 
 
 		 569 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  36.91 
 
 		 541 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.64 
 
 		 550 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.15 
 
 		 554 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  36.11 
 
 		 541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.78 
 
 		 581 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  35.5 
 
 		 562 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.56 
 
 		 563 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  36.01 
 
 		 567 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  36.65 
 
 		 541 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  43.58 
 
 		 536 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  34.4 
 
 		 557 aa  313  5.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  33.45 
 
 		 617 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.24 
 
 		 621 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  33.28 
 
 		 616 aa  312  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.29 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.92 
 
 		 554 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.28 
 
 		 616 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  35.48 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  36.61 
 
 		 542 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.93 
 
 		 597 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  35.28 
 
 		 544 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.92 
 
 		 555 aa  309  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.28 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  33.69 
 
 		 624 aa  307  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.77 
 
 		 622 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>